More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5537 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5537  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 
335 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1278  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  83.84 
 
 
297 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5280  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  73.56 
 
 
341 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5001  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  73.22 
 
 
341 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4912  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  73.22 
 
 
341 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.899758  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10126  serine protease pepA  48.21 
 
 
355 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.16358e-29  normal  0.942677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4674  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.89 
 
 
423 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  34.04 
 
 
389 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15600  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  34.82 
 
 
393 aa  136  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0395297  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.64 
 
 
487 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  36.33 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  36.7 
 
 
395 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  35.24 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  32.48 
 
 
453 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  28.49 
 
 
452 aa  125  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  33.21 
 
 
453 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  31.29 
 
 
393 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.04 
 
 
415 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  31.87 
 
 
453 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  34.83 
 
 
351 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  28.39 
 
 
453 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  33.1 
 
 
402 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  33.22 
 
 
525 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.39 
 
 
524 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3537  2-alkenal reductase  33.22 
 
 
387 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  31.99 
 
 
380 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  30.3 
 
 
459 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1464  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  35.71 
 
 
360 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  36.67 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.34 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.34 
 
 
405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  32.28 
 
 
459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  34.31 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  34.59 
 
 
389 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  31.79 
 
 
420 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  34.97 
 
 
361 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  34.25 
 
 
495 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  35.21 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.46 
 
 
450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  34.1 
 
 
418 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  31.66 
 
 
389 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.37 
 
 
384 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  35.47 
 
 
500 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  31.08 
 
 
411 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  35.77 
 
 
509 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  32.64 
 
 
480 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  34.77 
 
 
461 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  34.19 
 
 
478 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  29.4 
 
 
473 aa  117  1.9999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  29.45 
 
 
459 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1037  serine protease  32.01 
 
 
373 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0798  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.01 
 
 
365 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  35 
 
 
366 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  33.43 
 
 
584 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  32.96 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  28.98 
 
 
396 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.84 
 
 
405 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  29.31 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  35.14 
 
 
575 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  34.22 
 
 
423 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  32.01 
 
 
377 aa  116  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  31.21 
 
 
415 aa  116  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  32.55 
 
 
403 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  31.01 
 
 
377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  34.51 
 
 
588 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  32.08 
 
 
577 aa  115  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  33.7 
 
 
535 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.7 
 
 
471 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  28.48 
 
 
442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  30.72 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  33.98 
 
 
458 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  33.8 
 
 
494 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  34.51 
 
 
578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  30.25 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  28.81 
 
 
424 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  34.41 
 
 
362 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.93 
 
 
424 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.56 
 
 
544 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  32.79 
 
 
487 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  32.12 
 
 
348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  33.1 
 
 
490 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.34 
 
 
401 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.96 
 
 
428 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  30.14 
 
 
401 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  31.27 
 
 
497 aa  113  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  28.74 
 
 
467 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.13 
 
 
518 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.01 
 
 
512 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  33.1 
 
 
476 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  36.12 
 
 
502 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.77 
 
 
410 aa  112  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.19 
 
 
545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  33.69 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5068  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.99 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705563  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  36.29 
 
 
485 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  31.54 
 
 
464 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  31.3 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.77 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  35.55 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  35.55 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>