More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4965 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4965  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  84.49 
 
 		 247 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  81.22 
 
 		 245 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  80.82 
 
 		 245 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  81.22 
 
 		 245 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 		 250 aa  171  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0013  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000501062  n/a   
 
 
 
NC_007908  Rfer_4186  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2066  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118637  normal  0.754365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1582  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.269882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3677  GntR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0836  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00839653 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5470  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 242 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1509  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0756  transcriptional regulator, GntR family  34.71 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.612329  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4147  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1440  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4699  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4416  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 258 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.489132  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3625  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0484961  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1071  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4599  Fis family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279562  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.95 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1614  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.842348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  27.27 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  26.61 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.2 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  25.73 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  28.22 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0126  regulatory protein GntR HTH  45.78 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0616081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0121  regulatory protein GntR, HTH  45.78 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000430087  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  45.16 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  28.94 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  25.54 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003719  histidine utilization repressor  26.38 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.746481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2038  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335666 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  46.27 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  46.27 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  24.69 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02076  hypothetical protein  24.57 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  45.95 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49630  transcriptional regulator  27.65 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  41.56 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3979  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  48.48 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.577756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  48 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  23.4 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  38.82 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4235  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  57.14 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  47.5 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2064  GntR domain protein  41.59 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.51 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>