More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2038 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2038  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335666 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3895  putative transcriptional regulator  32.49 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.221719  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1119  GntR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4965  regulatory protein GntR, HTH  28.11 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0129  UbiC transcription regulator-associated domain protein  40.96 
 
 		 579 aa  64.3  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.625714 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1691  GntR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0269955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  27.52 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  25.61 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1440  GntR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  42.03 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000910713  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 480 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  42.03 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000218359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  45.71 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  39.08 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 480 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  23.5 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  27.4 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  46.67 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  26.81 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5996  regulatory protein GntR HTH  42.03 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.802632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4009  regulatory protein GntR, HTH  42.03 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4358  regulatory protein GntR, HTH  42.03 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  35 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.95 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0756  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.612329  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  29.21 
 
 		 480 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  33.72 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 480 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  44.44 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 477 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2066  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118637  normal  0.754365 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  33.72 
 
 		 485 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1662  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00118308  normal  0.121792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4186  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 503 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  24.4 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2105  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.57 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.158429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3677  GntR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00713  transcription regulator protein  26.45 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000339699  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2488  GntR family transcriptional regulator N-terminal  32.95 
 
 		 110 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0979102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4685  GntR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  36.23 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3625  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0484961  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4702  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.59 
 
 		 593 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 337 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  43.28 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1582  GntR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.269882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  27.7 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  28.12 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  24.22 
 
 		 301 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  49.25 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  44.78 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 461 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  41.1 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>