More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4890 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
403 aa  767    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  86.35 
 
 
403 aa  609  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  63.01 
 
 
420 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  63.32 
 
 
409 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  55.67 
 
 
402 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  54.62 
 
 
403 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  55.87 
 
 
414 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  58.12 
 
 
425 aa  361  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  57.56 
 
 
416 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  56.55 
 
 
407 aa  349  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  58.18 
 
 
419 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  52.79 
 
 
407 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  54.86 
 
 
382 aa  342  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 
408 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  53.63 
 
 
405 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  49.37 
 
 
409 aa  335  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  50.53 
 
 
405 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  50.67 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  55.86 
 
 
411 aa  324  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  53.39 
 
 
414 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  57.33 
 
 
411 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  47.4 
 
 
414 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  52.02 
 
 
399 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  54.64 
 
 
412 aa  316  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  51.11 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  52.21 
 
 
360 aa  312  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  47.91 
 
 
430 aa  312  6.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  51.61 
 
 
411 aa  312  6.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
400 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  57.22 
 
 
409 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  48.4 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  48.58 
 
 
422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  47.43 
 
 
394 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  47.2 
 
 
394 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  47.15 
 
 
394 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  46.05 
 
 
406 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  50.27 
 
 
393 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  48.73 
 
 
406 aa  293  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  57.63 
 
 
408 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  47.78 
 
 
405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  45.31 
 
 
407 aa  285  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  51.22 
 
 
392 aa  283  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  42.74 
 
 
392 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 
391 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  46.88 
 
 
391 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  46.88 
 
 
391 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  48.24 
 
 
395 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  44.57 
 
 
390 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  44.59 
 
 
389 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  44.59 
 
 
389 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  44.57 
 
 
390 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  44.57 
 
 
390 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  44.57 
 
 
390 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  45.95 
 
 
395 aa  275  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  44.57 
 
 
390 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  44.99 
 
 
390 aa  275  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  44.57 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  44.06 
 
 
389 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  44.57 
 
 
390 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  45.76 
 
 
400 aa  272  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  46.59 
 
 
395 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  44.26 
 
 
392 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  46.59 
 
 
395 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  44.33 
 
 
389 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  44.84 
 
 
385 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  42.93 
 
 
408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  41.73 
 
 
391 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.92 
 
 
388 aa  269  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  44.29 
 
 
367 aa  268  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  45.79 
 
 
397 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  46.57 
 
 
389 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  44.76 
 
 
388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08020  arabinose efflux permease family protein  46.21 
 
 
471 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.923974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 
388 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  45.64 
 
 
385 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  44.29 
 
 
405 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  44.29 
 
 
403 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  46.02 
 
 
405 aa  265  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  42.82 
 
 
391 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  44.01 
 
 
403 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  42.43 
 
 
389 aa  262  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  43.1 
 
 
391 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  41.84 
 
 
391 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 
386 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  43.44 
 
 
404 aa  260  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  46.89 
 
 
389 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  45.61 
 
 
384 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  46.01 
 
 
393 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  40.16 
 
 
388 aa  257  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 
397 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  41.94 
 
 
416 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  42.25 
 
 
391 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  45.92 
 
 
391 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 
411 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 
408 aa  256  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  44.93 
 
 
407 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  44.93 
 
 
407 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>