152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1581 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1581  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
335 aa  666    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812557  normal  0.120024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5460  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.07 
 
 
338 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5081  Rieske (2Fe-2S) region  66.07 
 
 
338 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.040812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5169  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.07 
 
 
338 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.787894  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1843  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.3 
 
 
367 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26470  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  63.16 
 
 
335 aa  378  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  59.32 
 
 
325 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3077  putative methylesterase  58.07 
 
 
334 aa  348  8e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0868692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3571  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  57.23 
 
 
336 aa  328  6e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  50.49 
 
 
811 aa  275  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.4 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.45 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.06 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.06 
 
 
361 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  26.35 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0420  Rieske (2Fe-2S) protein  28.49 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  37.38 
 
 
370 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  36.45 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  30.85 
 
 
376 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  26.42 
 
 
349 aa  61.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.51 
 
 
370 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  36.45 
 
 
370 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.58 
 
 
370 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  27.23 
 
 
373 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0280  Rieske (2Fe-2S) protein  26.55 
 
 
351 aa  59.7  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  36.89 
 
 
346 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.14 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.55 
 
 
354 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.71 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.74 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.88 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  25.47 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  26.74 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.74 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.92 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.14 
 
 
355 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.14 
 
 
355 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  35.23 
 
 
351 aa  56.6  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  26.74 
 
 
359 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  40.3 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.11 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.05 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  26.4 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.73 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.19 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  34.25 
 
 
351 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  30.14 
 
 
354 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  25 
 
 
353 aa  53.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.31 
 
 
388 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  26.53 
 
 
363 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  30.56 
 
 
354 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4325  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.5 
 
 
369 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  41.79 
 
 
352 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.92 
 
 
410 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.65 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.79 
 
 
352 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.79 
 
 
352 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 
373 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.41 
 
 
449 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  42.19 
 
 
356 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0852  Rieske (2Fe-2S) region  23.85 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.467283  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.91 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  24.1 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1576  Rieske (2Fe-2S) region  43.14 
 
 
358 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  36.14 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.78 
 
 
217 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.3 
 
 
217 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.9 
 
 
359 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.76 
 
 
351 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  22.86 
 
 
362 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.19 
 
 
321 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.19 
 
 
324 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1543  vanillate monooxygenase  22.09 
 
 
366 aa  50.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111008  hitchhiker  0.00152746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
332 aa  49.7  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.77 
 
 
364 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.89 
 
 
221 aa  49.7  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  24.43 
 
 
349 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.89 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2753  Rieske (2Fe-2S) region  36.47 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  23.03 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  19.58 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  25.45 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  23.03 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.03 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  20 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  30.99 
 
 
444 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  30.99 
 
 
444 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.03 
 
 
356 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  23.86 
 
 
347 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  33.67 
 
 
588 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.76 
 
 
356 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0504  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.3 
 
 
337 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.725699  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.18 
 
 
365 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.76 
 
 
356 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  32.05 
 
 
377 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4970  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
328 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22227  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.27 
 
 
347 aa  46.6  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  22.84 
 
 
359 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  31.75 
 
 
359 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>