More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1208 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0903  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  69.34 
 
 		 580 aa  701    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5131  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  80.11 
 
 		 555 aa  809    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0897  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  69.68 
 
 		 580 aa  697    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0914  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  69.68 
 
 		 580 aa  697    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1208  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  100 
 
 		 551 aa  1087    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10640  exonuclease V alpha subunit recD  66.49 
 
 		 575 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.47997e-19  normal  0.376997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0253  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  51.52 
 
 		 584 aa  438  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3374  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  50.42 
 
 		 616 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3906  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  51.08 
 
 		 632 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.436608  normal  0.0788816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2294  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  46 
 
 		 598 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0994  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  47.47 
 
 		 634 aa  368  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0120944  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2430  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  46.38 
 
 		 647 aa  355  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869931  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2745  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  43.19 
 
 		 641 aa  323  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1432  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.87 
 
 		 576 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00407883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0323  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.05 
 
 		 599 aa  296  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2150  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.67 
 
 		 604 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00157683  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2933  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.65 
 
 		 646 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.238613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1892  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.05 
 
 		 594 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087164  hitchhiker  0.00000000000433292 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2548  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.65 
 
 		 650 aa  294  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.975526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0343  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.68 
 
 		 599 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1056  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.81 
 
 		 609 aa  286  9e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.923429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0578  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.29 
 
 		 601 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1535  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.5 
 
 		 595 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0770  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.84 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0335755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1358  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.05 
 
 		 588 aa  280  6e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1400  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.64 
 
 		 581 aa  276  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3231  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.39 
 
 		 639 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00025834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3219  exonuclease V subunit alpha  37.56 
 
 		 611 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3205  exonuclease V subunit alpha  37.56 
 
 		 611 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3156  exonuclease V subunit alpha  37.23 
 
 		 611 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3139  exonuclease V subunit alpha  37.23 
 
 		 611 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3319  exonuclease V subunit alpha  37.06 
 
 		 611 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.940485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3262  exonuclease V subunit alpha  37.34 
 
 		 607 aa  262  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4084  exonuclease V subunit alpha  37.38 
 
 		 608 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2965  exonuclease V subunit alpha  37.38 
 
 		 608 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4567  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.71 
 
 		 708 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1170  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.84 
 
 		 655 aa  260  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768019  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2966  exonuclease V subunit alpha  37.01 
 
 		 608 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0872  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.22 
 
 		 608 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.938405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0896  exonuclease V subunit alpha  37.22 
 
 		 608 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3139  exonuclease V subunit alpha  37.22 
 
 		 608 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3043  exonuclease V subunit alpha  37.22 
 
 		 608 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.225396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02667  exonuclease V (RecBCD complex), alpha chain  37.22 
 
 		 608 aa  259  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02628  hypothetical protein  37.22 
 
 		 608 aa  259  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.627808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0010  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.67 
 
 		 750 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0998  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.81 
 
 		 586 aa  253  9.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2131  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.44 
 
 		 662 aa  252  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0692  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.72 
 
 		 603 aa  250  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0690  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.71 
 
 		 702 aa  249  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2643  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.96 
 
 		 682 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1935  exodeoxyribonuclease V  36.88 
 
 		 683 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1902  exodeoxyribonuclease V  36.56 
 
 		 631 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55660  exodeoxyribonuclease V alpha chain  37.6 
 
 		 721 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4536  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.43 
 
 		 691 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636293  normal  0.640936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0371  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.58 
 
 		 588 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.219276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4672  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.98 
 
 		 691 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.156704 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0682  exodeoxyribonuclease V alpha chain  33.38 
 
 		 674 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2421  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.13 
 
 		 664 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3813  exonuclease V subunit alpha  38.37 
 
 		 621 aa  240  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.752384  hitchhiker  0.00686322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1987  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.74 
 
 		 676 aa  240  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000228018  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3230  exonuclease V subunit alpha  34.11 
 
 		 652 aa  240  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.91996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0762  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.17 
 
 		 691 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.089759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0915  exonuclease V subunit alpha  37.04 
 
 		 619 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.718919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0682  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.15 
 
 		 697 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4013  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.78 
 
 		 626 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.123788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2169  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.97 
 
 		 601 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4670  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.76 
 
 		 691 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281806 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03300  hypothetical protein  37.93 
 
 		 725 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1847  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.17 
 
 		 683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.401727  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002686  exodeoxyribonuclease V alpha chain  38.11 
 
 		 715 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1903  exodeoxyribonuclease V, 67 kDa subunit  38.65 
 
 		 706 aa  233  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1778  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.83 
 
 		 739 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000685942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3388  exonuclease V subunit alpha  36.7 
 
 		 618 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2026  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.73 
 
 		 681 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0778  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.66 
 
 		 697 aa  230  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51700  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  37.54 
 
 		 703 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3006  exonuclease V subunit alpha  34.81 
 
 		 616 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5137  Exodeoxyribonuclease V  36.72 
 
 		 749 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.34484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0522  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.92 
 
 		 735 aa  223  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.496827  hitchhiker  0.000245551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2147  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.93 
 
 		 712 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2112  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.14 
 
 		 686 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1292  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.36 
 
 		 731 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.255394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2247  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.4 
 
 		 701 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.271795 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1044  exonuclease V subunit alpha  32.82 
 
 		 657 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0992  exonuclease V subunit alpha  32.82 
 
 		 657 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1773  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.48 
 
 		 706 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1812  exodeoxyribonuclease V  39.31 
 
 		 639 aa  217  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2093  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.74 
 
 		 740 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1851  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.04 
 
 		 710 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1744  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.31 
 
 		 639 aa  217  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2292  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.74 
 
 		 740 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.615762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1126  exonuclease V, alpha subunit  33.14 
 
 		 734 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00308131  normal  0.011484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2046  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.38 
 
 		 739 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591294  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1758  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.39 
 
 		 737 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0805  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  35.54 
 
 		 703 aa  211  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.983579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2535  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.91 
 
 		 687 aa  210  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1980  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.89 
 
 		 714 aa  210  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4566  hypothetical protein  34.53 
 
 		 739 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2280  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.53 
 
 		 739 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1623  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.88 
 
 		 679 aa  204  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.127673  normal  0.170261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>