More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0944 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  100 
 
 
294 aa  586  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  91.16 
 
 
319 aa  547  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  72.76 
 
 
291 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  72.76 
 
 
291 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  72.76 
 
 
291 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  67.59 
 
 
294 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  63.31 
 
 
294 aa  333  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  62.4 
 
 
291 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  62.02 
 
 
291 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  62.02 
 
 
291 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  51.17 
 
 
661 aa  247  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.89 
 
 
292 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
305 aa  227  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  48.39 
 
 
659 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
668 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  45.67 
 
 
665 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  51.77 
 
 
665 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 
664 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 
671 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
295 aa  209  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  42.63 
 
 
295 aa  205  7e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  46.89 
 
 
341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  42.28 
 
 
650 aa  185  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 
671 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  41.76 
 
 
642 aa  176  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  47.74 
 
 
637 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 
653 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
280 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  41.13 
 
 
701 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
290 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
258 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
266 aa  122  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
252 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
264 aa  119  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.99 
 
 
244 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.12 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
261 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.11 
 
 
244 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  32.23 
 
 
262 aa  109  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
262 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
277 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  38.37 
 
 
241 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 
242 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  33.17 
 
 
257 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
266 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
255 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 
242 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.32 
 
 
230 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  34.17 
 
 
254 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  29.21 
 
 
270 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
247 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  34.18 
 
 
301 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
255 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
278 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
249 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
258 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 
241 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
245 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 
258 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 
249 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
253 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 
254 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
253 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.09 
 
 
260 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  33.16 
 
 
255 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  36.18 
 
 
256 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.51 
 
 
264 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  36.27 
 
 
544 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
347 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
241 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
244 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
284 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 
258 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
261 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  38.51 
 
 
252 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  34.67 
 
 
261 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 
260 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
252 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  34.95 
 
 
260 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 
276 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
339 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0490  gluconate 5-dehydrogenase  30.39 
 
 
265 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
272 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
317 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  38.04 
 
 
1270 aa  102  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 
254 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
246 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
246 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
261 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  36.32 
 
 
258 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
261 aa  102  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 
258 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 
287 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
239 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
246 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>