208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0255 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0255  UspA domain-containing protein  100 
 
 
162 aa  317  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0951611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0416  UspA domain-containing protein  85.8 
 
 
161 aa  256  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0605514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0228  hypothetical protein  68.87 
 
 
172 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0238  UspA domain-containing protein  68.87 
 
 
172 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0218  UspA domain-containing protein  66.23 
 
 
171 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0420  UspA domain protein  43.14 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4458  UspA domain protein  47.06 
 
 
200 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0969362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  43.24 
 
 
166 aa  97.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3100  UspA domain protein  28.82 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512511  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.56 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0990  hypothetical protein  32.43 
 
 
277 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1008  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
277 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1018  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
277 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  34.69 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.33 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4577  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
294 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  decreased coverage  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
163 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
167 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  28.1 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.21 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 
130 aa  51.6  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  29.56 
 
 
150 aa  51.6  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  32.45 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  28.57 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  45.83 
 
 
148 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  51.06 
 
 
305 aa  50.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.86 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  44.44 
 
 
283 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.48 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  42.42 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  47.92 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.19 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  27.22 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  27.85 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  29.87 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.45 
 
 
295 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  45.28 
 
 
151 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  45.1 
 
 
167 aa  47.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.65 
 
 
304 aa  47.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  32 
 
 
152 aa  47.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
167 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  30.13 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  27.95 
 
 
143 aa  47.4  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0705  universal stress protein  48.98 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.284573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.48 
 
 
157 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2428  universal stress protein  48.98 
 
 
191 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881321  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  30 
 
 
153 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  29.8 
 
 
155 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  36.71 
 
 
303 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
155 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 
155 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0758  universal stress protein  48.98 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1230  universal stress family protein  48.98 
 
 
201 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296096  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1156  universal stress family protein  48.98 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1723  universal stress protein  48.98 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1269  universal stress protein  27.45 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  28.3 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.75 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  26.42 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  46 
 
 
280 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  41.3 
 
 
306 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  29.14 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  26.92 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  31.65 
 
 
390 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  43.14 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  55.32 
 
 
301 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.81 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  31.45 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.354321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  30.07 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  30.07 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  46.81 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  26.85 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  50 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  31.82 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4456  UspA domain-containing protein  28.39 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38489  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  31.13 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  44.68 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.14 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  44 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  44 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.14 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  29.38 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  47.92 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 
325 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1569  universal stress protein  48.98 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  32.89 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  32.43 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  45.83 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>