More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0913 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.81 
 
 		 917 aa  681    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.67 
 
 		 898 aa  640    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 668 aa  1379    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.51 
 
 		 904 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.74 
 
 		 677 aa  642    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.4 
 
 		 893 aa  634  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.87 
 
 		 676 aa  630  1e-179  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.58 
 
 		 676 aa  627  1e-178  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  47.7 
 
 		 899 aa  624  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.07 
 
 		 901 aa  623  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.17 
 
 		 676 aa  624  1e-177  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.7 
 
 		 674 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.52 
 
 		 674 aa  611  1e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.1 
 
 		 900 aa  607  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.26 
 
 		 674 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.11 
 
 		 674 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.31 
 
 		 920 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  44.46 
 
 		 687 aa  596  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.51 
 
 		 688 aa  595  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.48 
 
 		 688 aa  595  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.24 
 
 		 879 aa  590  1e-167  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.88 
 
 		 688 aa  589  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.86 
 
 		 893 aa  586  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.64 
 
 		 688 aa  588  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.78 
 
 		 686 aa  587  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.25 
 
 		 689 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  43.79 
 
 		 745 aa  581  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  42 
 
 		 893 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.23 
 
 		 687 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.17 
 
 		 686 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.67 
 
 		 900 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  42.98 
 
 		 695 aa  567  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  42.17 
 
 		 689 aa  568  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.67 
 
 		 886 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.56 
 
 		 906 aa  550  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.48 
 
 		 1421 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.97 
 
 		 911 aa  546  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  43.81 
 
 		 1387 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.88 
 
 		 1440 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  43.81 
 
 		 1412 aa  544  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.54 
 
 		 1428 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.61 
 
 		 1410 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.32 
 
 		 905 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.57 
 
 		 1440 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.33 
 
 		 1425 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.48 
 
 		 1425 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.46 
 
 		 927 aa  536  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.3 
 
 		 685 aa  533  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.62 
 
 		 685 aa  534  1e-150  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.19 
 
 		 1425 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.04 
 
 		 925 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.07 
 
 		 1406 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.96 
 
 		 662 aa  529  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.79 
 
 		 1424 aa  531  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.29 
 
 		 945 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.68 
 
 		 724 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.75 
 
 		 1432 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.09 
 
 		 754 aa  523  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.29 
 
 		 988 aa  522  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  42.44 
 
 		 1385 aa  521  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.25 
 
 		 1432 aa  522  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.11 
 
 		 1432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.8 
 
 		 1130 aa  513  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.35 
 
 		 903 aa  513  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.06 
 
 		 988 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.06 
 
 		 988 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.68 
 
 		 1111 aa  513  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.38 
 
 		 979 aa  511  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.74 
 
 		 937 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.36 
 
 		 1110 aa  509  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.27 
 
 		 989 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.39 
 
 		 989 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.39 
 
 		 989 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.24 
 
 		 989 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.52 
 
 		 963 aa  507  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.98 
 
 		 541 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.46 
 
 		 1426 aa  504  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.28 
 
 		 953 aa  503  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.09 
 
 		 957 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.9 
 
 		 924 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.71 
 
 		 1000 aa  501  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.83 
 
 		 963 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.07 
 
 		 947 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  39.82 
 
 		 957 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.65 
 
 		 979 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.54 
 
 		 961 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.45 
 
 		 942 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.59 
 
 		 949 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.21 
 
 		 982 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.47 
 
 		 983 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.06 
 
 		 956 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.25 
 
 		 687 aa  491  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  39.21 
 
 		 982 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.55 
 
 		 924 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  46.86 
 
 		 527 aa  492  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.79 
 
 		 973 aa  489  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.71 
 
 		 718 aa  492  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.62 
 
 		 983 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.47 
 
 		 983 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.62 
 
 		 983 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>