More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0589 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 264 aa  549  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.17 
 
 		 292 aa  278  9e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  54.8 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  51.87 
 
 		 325 aa  264  8.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  51.85 
 
 		 340 aa  259  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  49.59 
 
 		 318 aa  256  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  50.81 
 
 		 304 aa  255  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  50.83 
 
 		 258 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.19 
 
 		 283 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  48.79 
 
 		 259 aa  248  9e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  46.48 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  45.71 
 
 		 264 aa  228  5e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  46.77 
 
 		 268 aa  228  5e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  45.38 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  43.03 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.08 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  42.98 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  44.49 
 
 		 264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.53 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  41.2 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  39.76 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  40.16 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  38.34 
 
 		 280 aa  185  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.8 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.31 
 
 		 276 aa  178  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  40.85 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  39.45 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.45 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.31 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.85 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  41.2 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.31 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.46 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.11 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  41.63 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  36.61 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  39.43 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  42.53 
 
 		 240 aa  165  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  35.94 
 
 		 257 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  37.7 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  38.15 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  39.36 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  38.37 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  39.29 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  36.28 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  38.76 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  37.02 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.29 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.15 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.15 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  36.96 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  37.36 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  39.08 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.16 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.99 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.99 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.99 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.99 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.99 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.99 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.99 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  39.45 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  41.89 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.01 
 
 		 243 aa  158  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.59 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  36.84 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.28 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.35 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.99 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  37.6 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.7 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.99 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  37.82 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.36 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.46 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  33.47 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  36.56 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  37.2 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0786  undecaprenyl diphosphate synthase  37.78 
 
 		 235 aa  155  8e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.676568 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  35.84 
 
 		 276 aa  154  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  37.17 
 
 		 272 aa  155  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  37.67 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1533  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.16 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.554505  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.99 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000341789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.99 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.86 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  36.68 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.15 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.68 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  37.35 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1712  undecaprenyl diphosphate synthase  35.62 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  36.78 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.45 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.75 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>