More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0472 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  100 
 
 		 327 aa  652    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  59.81 
 
 		 321 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  59.5 
 
 		 322 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  47.98 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  45.72 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  46.22 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  49.32 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  45 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  46.39 
 
 		 322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  45.57 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  42.06 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  42.99 
 
 		 320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  43.05 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  41.9 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  42.57 
 
 		 317 aa  222  8e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  42.05 
 
 		 317 aa  221  9e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  42.18 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  35.09 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  41.33 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  39.02 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  40.58 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  36.27 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  34.06 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  41.63 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.12 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  35.64 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  35.87 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  35.08 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  34.46 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  39.2 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  37.22 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  39.72 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  40.55 
 
 		 325 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.27 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  35.22 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  35.1 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  35.27 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.82 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  37.8 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.87 
 
 		 322 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.98 
 
 		 322 aa  182  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  34.03 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  35.4 
 
 		 345 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  35.35 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  35.95 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  36.39 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  35.26 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.99 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  34.97 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  34.05 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.61 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  32.92 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  35.05 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.03 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  32.2 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  32.88 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  32.88 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  32.88 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  31.53 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  32.88 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  34.95 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  31.53 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  32.88 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  32.88 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  31.53 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  32.65 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  35.64 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  32.88 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  31 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  34.29 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  32.88 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  32.76 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33.53 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.25 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  32.41 
 
 		 370 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  32.41 
 
 		 370 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  32.41 
 
 		 370 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  32.41 
 
 		 370 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  32.41 
 
 		 370 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  32.53 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  32.99 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  35.29 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  36.21 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  33.79 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  33.23 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  36.21 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  36.86 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  35.15 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  31.58 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.69 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.65 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  31.23 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  33.79 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  31.58 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.73 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  34.06 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  30.48 
 
 		 331 aa  169  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>