More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2372 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2372  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 325 aa  647    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0195446 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7209  OmpA/MotB domain protein  50.17 
 
 		 652 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0110011 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6051  OmpA/MotB domain protein  51.03 
 
 		 642 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 200 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  34.03 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  34.29 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  34.29 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  34.29 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  34.29 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  34.29 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  34.29 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  36.7 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  34.29 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.74 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  33.57 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  34.48 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  37.23 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  32 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 193 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  32 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.17 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  41.46 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  41.46 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  35.51 
 
 		 523 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  41.46 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  41.46 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  41.46 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  41.46 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  33.62 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  41.46 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 534 aa  59.7  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  37.86 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 227 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 168 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  33.64 
 
 		 734 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  36.89 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 729 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  35.92 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  35.45 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3734  OmpA/MotB  28.9 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0228295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  33.65 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  34.95 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  34.58 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 217 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  33.53 
 
 		 352 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  36.94 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  26.88 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  34 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  30.28 
 
 		 613 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.05 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  34.55 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  34.55 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  29.32 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  34.58 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  34.55 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  34.55 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  34.55 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  34.55 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  34.55 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  45.12 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 243 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  42.17 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.18 
 
 		 521 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.94 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  33.94 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  34.55 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  33.01 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  34.51 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 234 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 637 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  33.64 
 
 		 231 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  32.73 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 		 222 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>