More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2340 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  100 
 
 		 487 aa  974    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 		 645 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 		 655 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 		 635 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  42.07 
 
 		 881 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  41.88 
 
 		 868 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38 
 
 		 854 aa  287  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  38.77 
 
 		 447 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 		 854 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  35.36 
 
 		 842 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 		 574 aa  280  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 856 aa  279  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  38.77 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 1159 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 		 1316 aa  274  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 1140 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 567 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  37.77 
 
 		 1141 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 1146 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  36.55 
 
 		 1142 aa  270  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 1146 aa  270  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  36.97 
 
 		 1145 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 1146 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 1145 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 		 744 aa  266  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 		 1146 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 1146 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 1146 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  36.99 
 
 		 1146 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 		 1169 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 556 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 		 1159 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 554 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 		 1172 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 		 1163 aa  259  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 1159 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1172 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  40.39 
 
 		 577 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 		 1140 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  37.59 
 
 		 1157 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.83 
 
 		 1169 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 1169 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  38.22 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  38.2 
 
 		 1159 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 		 1158 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 1159 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 1156 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 1171 aa  252  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 1170 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  38.28 
 
 		 1174 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 1140 aa  251  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  37.96 
 
 		 1159 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  37.99 
 
 		 454 aa  251  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  38.19 
 
 		 1169 aa  250  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  37.77 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 817 aa  249  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1817  histidine kinase  37.91 
 
 		 454 aa  249  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 816 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  35.6 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 		 1169 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1174 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  40.42 
 
 		 594 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  37.28 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.5 
 
 		 1158 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 1167 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 1169 aa  244  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 1168 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1152 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 883 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  37.65 
 
 		 1150 aa  242  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1251  histidine kinase  36.27 
 
 		 477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0537245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2593  hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 477 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 1177 aa  240  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 1152 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1111 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 662 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  35.92 
 
 		 1161 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 884 aa  234  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 884 aa  234  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 1145 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 1055 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 1147 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 672 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  37.99 
 
 		 591 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1168 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 880 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 621 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 571 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 545 aa  228  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 1177 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  37.4 
 
 		 609 aa  227  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  36.21 
 
 		 747 aa  227  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  35.76 
 
 		 881 aa  226  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  33.82 
 
 		 1148 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 589 aa  225  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 634 aa  223  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  36.41 
 
 		 545 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 1166 aa  220  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  34.79 
 
 		 676 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 758 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>