More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2148 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  73.15 
 
 		 165 aa  208  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  51.3 
 
 		 194 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  50.98 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  49.33 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  50.33 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  48.37 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  47.26 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  44.52 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  40.94 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  40.94 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  43.24 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  51.88 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  39.86 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  40.27 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  40.27 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  40.27 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  41.61 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  38.93 
 
 		 148 aa  121  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  40.27 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  41.91 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  38.51 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  39.46 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  40.15 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  38.71 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  38.1 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  39.58 
 
 		 174 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  38.06 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  37.93 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  37.24 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  36.17 
 
 		 146 aa  104  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  39.1 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  39.29 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  31.47 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  32.41 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  36.64 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  36.64 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  36.64 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  35.88 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  31.03 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  35.88 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  30.94 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  35.88 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  35.88 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  30.46 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  32.31 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3420  30S ribosomal protein S13  33.57 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610551  normal  0.118326 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  30.82 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  32.19 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  31.33 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  31.51 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  31.76 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  30.34 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  30.61 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1044  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  30.67 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  29.8 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  31.51 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  28.28 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1773  30S ribosomal protein S13  29.33 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.540759  normal  0.275864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  31.69 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  29.8 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  35.11 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4220  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  27.74 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>