210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1388 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  268  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  55.75 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  45.95 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  43.86 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  96.7  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  44.6 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  43.8 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  41.79 
 
 		 294 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  39.57 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  50.98 
 
 		 167 aa  91.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  47.75 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  43.57 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  41.13 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  42.2 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  38.28 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  36.17 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  46.32 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  43.59 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  44.55 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  43.59 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  40.52 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  36.92 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  42.98 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  40.32 
 
 		 183 aa  84  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  40.8 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  45.26 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  39.13 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  36.99 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3476  protein of unknown function UPF0066  43.12 
 
 		 283 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  37.72 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  38.1 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  48.39 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  42.11 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  39.67 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  41.41 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  38.6 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31759  predicted protein  40.91 
 
 		 286 aa  77  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.330463  normal  0.0179546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  41.96 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  36.76 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  42.86 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  33.87 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  34.59 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  34.29 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  38.4 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  39.2 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  41.88 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  36.89 
 
 		 336 aa  75.5  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  39.26 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  38.94 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  46.24 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  43.48 
 
 		 239 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  43.68 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  35.2 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  38.71 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  36 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  37.39 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  36.96 
 
 		 235 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  73.9  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  37.9 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  36.51 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  42.86 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  40.59 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  41.3 
 
 		 167 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  38 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  44.66 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  35.43 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.89 
 
 		 311 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  41.76 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  38.71 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  38.39 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  32.54 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  43.69 
 
 		 231 aa  70.1  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  34.59 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  41.58 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  41.41 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  35.56 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  35.2 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  39.81 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  32.54 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  35.9 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  42.68 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  31.75 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  31.75 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  43.16 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  32.54 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  38.1 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  32.54 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  40.17 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  40.43 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  43.75 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  30.95 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  30.95 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  40.59 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  42.35 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  43.53 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  36.08 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  36.8 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>