212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2181 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 380 aa  772    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  46.11 
 
 		 397 aa  318  9e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  28.47 
 
 		 409 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  23.6 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  28.93 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  29.1 
 
 		 399 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  27.62 
 
 		 411 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0931  hypothetical protein  28.09 
 
 		 385 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  26.03 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  28.4 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  27.65 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  26.3 
 
 		 369 aa  90.1  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  23.14 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  26.58 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.25 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  26.89 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  28.7 
 
 		 424 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  24.58 
 
 		 378 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  27.07 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  29.43 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  26.82 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  25.77 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.77 
 
 		 382 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  25.89 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  26.98 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  25.36 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  25.36 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  24.01 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  26.4 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  28.08 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  24.01 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  27.56 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1890  hypothetical protein  25.8 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  24.73 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  26.32 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  23.32 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.04 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  27.6 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24.38 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  26.7 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  22.73 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  25.52 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  25.55 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  22.38 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  26.22 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  22.95 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  26.7 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  26.72 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  26 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  25.26 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  22.82 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  25.77 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  24.3 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  26.04 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  28.42 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  21 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  25.98 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  26.33 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  26.45 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  25.76 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  25.76 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  24.26 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8073  ATPase-like protein  26.75 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  23.99 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  26.99 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4080  hypothetical protein  25.66 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  26.3 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  23.14 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2264  hypothetical protein  24.21 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000152095  unclonable  0.0000000148287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  26.03 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  24.65 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  23.21 
 
 		 369 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  24.67 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  26.17 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  25.64 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  26.33 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  25.07 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  21.13 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  24.32 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  25.75 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  26.29 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  26.62 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  22.11 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  25.4 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  24.93 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1945  hypothetical protein  26.76 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.710745  hitchhiker  0.000000000000362051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  27.05 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  24.29 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  27.05 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  24.6 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  21.89 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1106  hypothetical protein  25.43 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0316487  hitchhiker  0.000249477 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1235  SMC domain-containing protein  23.83 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  27.45 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  30.43 
 
 		 226 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  43.94 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3860  ATPase-like  21.47 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.247695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  24.74 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  46.77 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  31 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>