More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1693 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  100 
 
 
280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  69.17 
 
 
262 aa  367  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1339  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  68.77 
 
 
259 aa  363  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  68.5 
 
 
260 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  66.27 
 
 
264 aa  361  6e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  68.38 
 
 
259 aa  361  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1592  ABC transporter related  63.98 
 
 
265 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  67.06 
 
 
266 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  64.29 
 
 
262 aa  350  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4037  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
301 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.0177889 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2646  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.87 
 
 
266 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0914  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.47 
 
 
266 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1832  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.47 
 
 
266 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.405866  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1445  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
266 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.59093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0435  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
266 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125236  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1656  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
266 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1678  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
266 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0727  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
266 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2410  ABC transporter related  63.64 
 
 
282 aa  338  8e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1327  ABC sugar transporter, ATPase subunit  59.68 
 
 
278 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2808  ABC transporter related  59.68 
 
 
288 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163546  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  60.89 
 
 
262 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1599  ABC transporter related  59.68 
 
 
267 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.664694  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  60.48 
 
 
267 aa  326  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1276  ABC transporter related  59.68 
 
 
264 aa  325  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.233639  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4494  ABC transporter related  62.65 
 
 
316 aa  321  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00159832  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  59.68 
 
 
266 aa  316  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0058  ABC transporter related  59.27 
 
 
266 aa  316  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  60.33 
 
 
294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0832  ABC transporter related  59.92 
 
 
305 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0378548  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2607  ABC transporter related  57.94 
 
 
274 aa  298  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4009  ABC transporter-related protein  58.73 
 
 
274 aa  298  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3600  ABC transporter related protein  56.35 
 
 
289 aa  295  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  56.3 
 
 
258 aa  294  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0115  ABC transporter related  57.94 
 
 
315 aa  292  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1360  ABC transporter related protein  55.95 
 
 
269 aa  291  9e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  57.87 
 
 
255 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4052  ABC transporter related  54.34 
 
 
282 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146234  normal  0.303462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2770  ABC transporter related protein  55.34 
 
 
271 aa  282  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4535  ABC transporter related  54.86 
 
 
274 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0654  ABC transporter related protein  54.33 
 
 
267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2316  ABC transporter related  51.89 
 
 
267 aa  266  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.573379  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1210  ABC transporter related  48.56 
 
 
259 aa  237  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0047  ABC transporter related  50.42 
 
 
247 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  46.53 
 
 
249 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  46.5 
 
 
244 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  45.9 
 
 
262 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3432  ABC transporter related  48.88 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731931  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  46.69 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5757  ABC transporter related  45.49 
 
 
257 aa  211  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  46.06 
 
 
273 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  43.65 
 
 
260 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 
258 aa  210  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0071  ABC transporter related  44.53 
 
 
259 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  45.08 
 
 
277 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2415  ABC transporter related  43.87 
 
 
273 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133775  normal  0.475676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  42.62 
 
 
263 aa  208  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 
265 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  44.26 
 
 
265 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  42.98 
 
 
518 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.56 
 
 
527 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5833  ABC transporter related  45.58 
 
 
243 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150147  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.56 
 
 
524 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  43.39 
 
 
524 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.15 
 
 
524 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.15 
 
 
524 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.15 
 
 
524 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  43.31 
 
 
268 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1375  ABC transporter related  43.67 
 
 
257 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143315  normal  0.0808581 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
288 aa  202  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  42.56 
 
 
524 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0128  ABC transporter related  43.32 
 
 
260 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  44.4 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2043  ABC transporter related  43.43 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332554  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  41.98 
 
 
258 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0127  ABC transporter related  42.91 
 
 
265 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  43.44 
 
 
257 aa  199  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  43.15 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  43.44 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0388  ribose import ATP-binding protein rbsA  42.69 
 
 
261 aa  199  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.956313 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0892  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 
265 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4579  ABC transporter related  42.29 
 
 
265 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00500559  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  42.45 
 
 
276 aa  198  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  42.39 
 
 
257 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  44.14 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0370  ABC transporter related  43.48 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4187  ABC transporter related  42.8 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  42.13 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0493  ABC transporter related  41.06 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0504196  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  42.51 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  41.74 
 
 
516 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0104  ABC transporter related  42.74 
 
 
260 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394211  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  40.57 
 
 
521 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1461  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0236  ABC transporter related  43.31 
 
 
258 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.762191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0503  ABC transporter related  43.72 
 
 
264 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0988  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
258 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  41.02 
 
 
285 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2648  ABC transporter related  42.91 
 
 
258 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>