More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0135 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 255 aa  519  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  83.4 
 
 		 255 aa  420  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  57.09 
 
 		 269 aa  311  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  57.87 
 
 		 269 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  56.52 
 
 		 270 aa  300  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  53.38 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  58.63 
 
 		 269 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  55.38 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  61.29 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  56.97 
 
 		 280 aa  292  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  54.98 
 
 		 273 aa  291  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  55.38 
 
 		 269 aa  291  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  58.23 
 
 		 269 aa  291  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  54.98 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  53.01 
 
 		 276 aa  291  8e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.18 
 
 		 269 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  55.78 
 
 		 274 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  55.38 
 
 		 261 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  55.65 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  54.98 
 
 		 261 aa  289  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  54.98 
 
 		 274 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.98 
 
 		 279 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  55.78 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  54.58 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  55.82 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  55.78 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  54.98 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  54.18 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  53.78 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.67 
 
 		 270 aa  285  7e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  55.38 
 
 		 265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  54.18 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  53.78 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  54.18 
 
 		 264 aa  283  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  54.58 
 
 		 277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  56.45 
 
 		 282 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  54.58 
 
 		 269 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  56.45 
 
 		 275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  53.78 
 
 		 274 aa  281  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  56.05 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  54.62 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  55.2 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  55.42 
 
 		 276 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  54.58 
 
 		 265 aa  278  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  53.78 
 
 		 265 aa  274  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  56.63 
 
 		 278 aa  274  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 273 aa  272  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  54.72 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  53.78 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  52.61 
 
 		 289 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  56.13 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.41 
 
 		 264 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  51.78 
 
 		 277 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.38 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  54.39 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  54 
 
 		 289 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  52.4 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  50.6 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  51.6 
 
 		 251 aa  251  6e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3008  ABC transporter-related protein  50.39 
 
 		 275 aa  248  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00336682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  45.97 
 
 		 256 aa  244  9e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  47.95 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  47.39 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  47.62 
 
 		 282 aa  237  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  48.62 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  45.56 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  47.81 
 
 		 264 aa  235  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.8 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  46.25 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4938  ABC transporter related  44.88 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.584937  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  49.4 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  48 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  47.41 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  48.05 
 
 		 256 aa  231  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  44.66 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  46.18 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  43.19 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  44.35 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  45.02 
 
 		 264 aa  228  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  46.37 
 
 		 259 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  47.27 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  44.35 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  45.63 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  45.2 
 
 		 255 aa  225  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  47.01 
 
 		 262 aa  224  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  47.18 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  46.03 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  44.53 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  45.42 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  44.8 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  43.45 
 
 		 284 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  45.82 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  45.2 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>