153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4132 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  100 
 
 
315 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  51.27 
 
 
312 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  54.29 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  51.39 
 
 
297 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  48.59 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  52.46 
 
 
309 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  44.1 
 
 
310 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  44.1 
 
 
310 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  50 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  43.17 
 
 
310 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  51.09 
 
 
273 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  47.52 
 
 
304 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  48.24 
 
 
320 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  45.52 
 
 
310 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  48.4 
 
 
308 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  41.67 
 
 
272 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  47.33 
 
 
290 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  45.69 
 
 
274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  43.51 
 
 
311 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  42.38 
 
 
282 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  45.11 
 
 
293 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  45.11 
 
 
293 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  45.11 
 
 
293 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  42.05 
 
 
280 aa  198  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  42.32 
 
 
286 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  38.64 
 
 
271 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  42.24 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  39.78 
 
 
275 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  39.78 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  39.41 
 
 
289 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  37.88 
 
 
271 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  39.13 
 
 
290 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  38.91 
 
 
287 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  35.79 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  35.34 
 
 
283 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  35.34 
 
 
287 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  40.5 
 
 
300 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  32.19 
 
 
323 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  38.55 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  37.32 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  38.36 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  36.73 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  39.02 
 
 
300 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  39.13 
 
 
286 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  35.49 
 
 
290 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  36.13 
 
 
286 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  34.33 
 
 
320 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  35.09 
 
 
327 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  38.32 
 
 
289 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  36.33 
 
 
289 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  34.35 
 
 
302 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  34.52 
 
 
306 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  33.55 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  38.63 
 
 
295 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
291 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  33.68 
 
 
304 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  33.69 
 
 
289 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  33.67 
 
 
305 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  33.01 
 
 
312 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
304 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  35.87 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  32.63 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  32.58 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  35.25 
 
 
296 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  33.7 
 
 
302 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  34.75 
 
 
305 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  35.97 
 
 
295 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  35.02 
 
 
295 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  35.97 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  34.56 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  33.81 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  32.65 
 
 
313 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  34.81 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  36.03 
 
 
324 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  43.56 
 
 
198 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  36.53 
 
 
296 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  36.03 
 
 
327 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  43.56 
 
 
198 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  36.03 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  35.79 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  35.79 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  35.79 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  35.79 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  32.62 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  37.82 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  33.85 
 
 
306 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  31.1 
 
 
290 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  33.85 
 
 
306 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  32.75 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
296 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  34.91 
 
 
276 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  33.58 
 
 
298 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  33.89 
 
 
297 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  35.31 
 
 
285 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  32.73 
 
 
303 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  36.16 
 
 
277 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  32.1 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  36.09 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  32.22 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>