165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0232 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  100 
 
 		 429 aa  842    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  48.57 
 
 		 440 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  51.63 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  47.84 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  53.03 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  48.44 
 
 		 442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  49.53 
 
 		 442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  47.96 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  47.96 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  47.96 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  47.96 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  47.96 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  47.72 
 
 		 442 aa  352  5e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  47.72 
 
 		 442 aa  352  5e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  45.19 
 
 		 445 aa  352  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  50.12 
 
 		 448 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  47 
 
 		 440 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  47 
 
 		 440 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  49.88 
 
 		 448 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  47 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  47 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  47 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  48.58 
 
 		 449 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  44.76 
 
 		 432 aa  346  5e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  50.47 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  46.02 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  45.43 
 
 		 443 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  44.14 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  48.67 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  48.77 
 
 		 451 aa  338  7e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  44.17 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  49.18 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  45.69 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  48.55 
 
 		 451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  46.67 
 
 		 422 aa  335  5.999999999999999e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  44.93 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  44.68 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  52.32 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  45.19 
 
 		 446 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  44.69 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  45.66 
 
 		 456 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  52.77 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  44.94 
 
 		 446 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  44.94 
 
 		 446 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  44.94 
 
 		 464 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  44.94 
 
 		 446 aa  328  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  45.07 
 
 		 443 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  48.18 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  46.14 
 
 		 445 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  43.3 
 
 		 449 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  43.75 
 
 		 443 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  45.67 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  43.03 
 
 		 443 aa  322  7e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  46 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  38.63 
 
 		 473 aa  303  5.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  41.16 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  51.71 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  51.46 
 
 		 445 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  51.46 
 
 		 445 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  54.65 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  54.24 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  26.64 
 
 		 753 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  49.14 
 
 		 155 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  49.14 
 
 		 155 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  28.81 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  26.52 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  26.81 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  28.69 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  27.73 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.5 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  28.19 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  29.54 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0309  L-threonine ammonia-lyase  26.07 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  26.78 
 
 		 507 aa  56.6  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  25.94 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  25 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6086  hypothetical protein  26.09 
 
 		 327 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  25 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  27.38 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  22.98 
 
 		 291 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  27.34 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  22.98 
 
 		 290 aa  54.7  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  26.32 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  24.32 
 
 		 511 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  25.94 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13987  predicted protein  24.7 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3492  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.74 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  27.85 
 
 		 526 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  29.6 
 
 		 308 aa  51.6  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3254  hypothetical protein  25.81 
 
 		 330 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  29.11 
 
 		 519 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  26.23 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  29.11 
 
 		 519 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  28.69 
 
 		 530 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  28.87 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1773  tryptophan synthase subunit beta  25.77 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  26.42 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  26.86 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  28.03 
 
 		 523 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  24.84 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>