140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3634 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  94.03 
 
 		 408 aa  666    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 403 aa  772    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  94.74 
 
 		 403 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  78.26 
 
 		 402 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  72.95 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  45.81 
 
 		 407 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  40.85 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  31.81 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.87 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.81 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  21.33 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  20.53 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  21.46 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  27.44 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.53 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  22.59 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  23.8 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 268 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  33.14 
 
 		 371 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  19.11 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  25.36 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  22.06 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  21.28 
 
 		 360 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  30.39 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  25.37 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  20.16 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 281 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.8 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  27.14 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  22.03 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  23.04 
 
 		 242 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2899  hypothetical protein  24.24 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0941072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3385  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 		 385 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.64 
 
 		 384 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.92 
 
 		 384 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  23.6 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  22.49 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  22.64 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  21.94 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  19.14 
 
 		 380 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  21.41 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  26.01 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  22.34 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  28.12 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  28.12 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  28.12 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  28.12 
 
 		 368 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  28.12 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.34 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  27.34 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  27.34 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  27.34 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  27.34 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  27.34 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  27.34 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  26.01 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 278 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6993  ABC-2 type transporter  33.57 
 
 		 268 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>