More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2281 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 171 aa  332  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  90.64 
 
 		 171 aa  288  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  90.06 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  80.59 
 
 		 171 aa  245  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  71.88 
 
 		 165 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  69.23 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  55.63 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  50.65 
 
 		 165 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  51.22 
 
 		 164 aa  143  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  48.47 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  46.95 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  53.64 
 
 		 171 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  48.97 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  60 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  49.67 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  44.12 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  42.65 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  45.91 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  44.87 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  39.38 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 163 aa  100  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  40.76 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  42.18 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1715  lipoprotein signal peptidase  49.7 
 
 		 165 aa  99  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 154 aa  98.6  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1394  lipoprotein signal peptidase  51.05 
 
 		 190 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.660722  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 172 aa  97.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 172 aa  97.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 173 aa  97.4  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  38.06 
 
 		 227 aa  93.2  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  45.3 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  39.86 
 
 		 158 aa  91.7  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 159 aa  91.7  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  31.52 
 
 		 182 aa  91.3  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 182 aa  91.3  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  34.39 
 
 		 172 aa  90.9  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 169 aa  90.9  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  37.84 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  36.05 
 
 		 189 aa  89  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  35.42 
 
 		 168 aa  87.4  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  44.83 
 
 		 123 aa  87.4  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2356  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0383384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  38.3 
 
 		 157 aa  86.7  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  36.91 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  38.02 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  31.03 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 170 aa  85.1  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  32.26 
 
 		 170 aa  84.3  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  39.24 
 
 		 164 aa  84.3  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  38.02 
 
 		 164 aa  84  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  31.37 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  32.65 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  37.4 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  39.67 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  34.71 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  30.77 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  35.82 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>