More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2171 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  100 
 
 
287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  93.33 
 
 
286 aa  508  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  92.96 
 
 
296 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  67.27 
 
 
275 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  68.32 
 
 
278 aa  359  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  66.03 
 
 
282 aa  357  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  51.4 
 
 
279 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  51.05 
 
 
274 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  50.7 
 
 
274 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  53.33 
 
 
282 aa  285  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  50 
 
 
275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  46.27 
 
 
273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  42.97 
 
 
289 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  41.11 
 
 
278 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  40.07 
 
 
274 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  40.07 
 
 
274 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  43.17 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  39.41 
 
 
265 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  41.39 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  43.68 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  40.52 
 
 
272 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  40.43 
 
 
266 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  38.71 
 
 
275 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  40.43 
 
 
266 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  37.98 
 
 
274 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  39.78 
 
 
265 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  38.75 
 
 
276 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  41.91 
 
 
263 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  38.89 
 
 
264 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  42.91 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  38.41 
 
 
276 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  40.75 
 
 
267 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  37.92 
 
 
259 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  37.92 
 
 
259 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  40.29 
 
 
281 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  40.52 
 
 
259 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  37.02 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  41 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  39.78 
 
 
292 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  38.66 
 
 
273 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  37.17 
 
 
265 aa  172  7.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  39.21 
 
 
281 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  41.22 
 
 
273 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  39.34 
 
 
259 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  38.6 
 
 
270 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  37.17 
 
 
268 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  37.92 
 
 
266 aa  165  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  35.44 
 
 
291 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  35.53 
 
 
265 aa  159  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  36.59 
 
 
311 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  35.45 
 
 
266 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  35.44 
 
 
266 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  36.07 
 
 
273 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  34.03 
 
 
316 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.57 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  35.14 
 
 
272 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  31.38 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  35.38 
 
 
288 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  35.42 
 
 
293 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  32.03 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  30.41 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  31.6 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  31.35 
 
 
293 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  32.21 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  32.21 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  32.21 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  32.21 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  32.21 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  32.21 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  32.21 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  33.82 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  32.51 
 
 
280 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  29.05 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  29.97 
 
 
295 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  33.09 
 
 
271 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  30.47 
 
 
272 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  28.42 
 
 
272 aa  122  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2048  transglutaminase domain protein  30.88 
 
 
654 aa  122  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  29.23 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  29.43 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  31.53 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  31.68 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  33.56 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  28.06 
 
 
273 aa  119  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.67 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  29.14 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  31.02 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  30.39 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12437  hypothetical protein  30.63 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.670286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0517  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  29.68 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  32.28 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  31.99 
 
 
314 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  28.52 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  30.59 
 
 
304 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  28.67 
 
 
332 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  30.07 
 
 
296 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  30.96 
 
 
279 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  30.96 
 
 
279 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  30.96 
 
 
279 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>