135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0271 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0271  LemA protein  100 
 
 		 213 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.497624  hitchhiker  0.00615451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  40.21 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  37.11 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4005  LemA family protein  34.41 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000752628 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  34.72 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  36 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  32.07 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  30.81 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  31.25 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  35.96 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  35.23 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  33.72 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  31.58 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  36.7 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  27.32 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  28.5 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  30.98 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  33.16 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  29.12 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  26.42 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  30.68 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  30.21 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  32.79 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0590  hypothetical protein  33.5 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  31.32 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  30 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  30 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  30 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  34.3 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  28.25 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  30.77 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  27.93 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  30.54 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  26.63 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3244  hypothetical protein  35.38 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0741047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  21.54 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  29.63 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  27.18 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0512  hypothetical protein  33.16 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  29.59 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  31.49 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3895  hypothetical protein  34.87 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  29.69 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  28.16 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4529  hypothetical protein  32.32 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  29.81 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  29.61 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  30.22 
 
 		 183 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  25.43 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  30.11 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  27.51 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  28.42 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  24.86 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  27.42 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  29.44 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  24.86 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  26.67 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  27.66 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  29.05 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  26.59 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  25.54 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  29.44 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  27.93 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  27.81 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  29.67 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  28.33 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  26.56 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  27.8 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  29.52 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  29.41 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  26.09 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  26.97 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  29.41 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  29.76 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  27.64 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  27.32 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  26.15 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  27.17 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  25 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  27.04 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  25 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  28.65 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  26.23 
 
 		 182 aa  52.4  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  28.99 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  33.52 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  27.43 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  32.4 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  25.42 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  26.82 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  22 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  23.37 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  25.98 
 
 		 433 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  25.56 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  29.19 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  32.95 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  33.33 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  29.19 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0452  hypothetical protein  25.29 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0428  hypothetical protein  25.29 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  27.42 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>