115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4005 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4005  LemA family protein  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000752628 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  35.84 
 
 		 197 aa  98.6  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  33.71 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  30.3 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0271  LemA protein  34.41 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.497624  hitchhiker  0.00615451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  31.52 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  30 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  32.08 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  27.49 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  29.55 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  29.65 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  26.74 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  28.93 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  30.86 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  29.59 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  32.05 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  30.72 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  27.95 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  25.7 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  28.9 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  30.05 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  31.85 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  28.05 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  29.94 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  25.68 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  30.95 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  29.71 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  27.93 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  27.37 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  28.74 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  27.27 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  28.81 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0512  hypothetical protein  30.65 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345875 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  25 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3244  hypothetical protein  28.8 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0741047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  28.81 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3895  hypothetical protein  28.8 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  27.68 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  28.74 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  26.14 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  26.55 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  27.33 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  27.12 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  29.34 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  30.77 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  29.03 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  24.69 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  26.23 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  23.21 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  25.95 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  25.93 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0453  hypothetical protein  25.27 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4529  hypothetical protein  32.65 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  24.87 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  25.65 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  28.57 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  27.54 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  24.86 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  24.6 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2430  LemA family protein  24.85 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  27.16 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0409  LemA family protein  25.27 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662835 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  28 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  25.73 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  27.88 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  23.6 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  23.37 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  28.74 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  24.72 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  23.56 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  24.71 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  24.68 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4437  LemA family protein  23.03 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4499  LemA family protein  23.03 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.625347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0598  LemA family protein  22.4 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  24.28 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  24.71 
 
 		 433 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  27.37 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  23.39 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  26.01 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  25 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  25.57 
 
 		 183 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  26.38 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  25.93 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  27.27 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  25 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  25.84 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  25.29 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  26.29 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  28.3 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  24.71 
 
 		 434 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  23.5 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  26.71 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  27.13 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  27.27 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25170  hypothetical protein  28.92 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  25.97 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  22.54 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>