More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7040 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7040  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8023  two component transcriptional regulator, LuxR family  75.35 
 
 		 217 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.634105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0653  two component LuxR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 217 aa  223  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6781  two component LuxR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7525  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.2 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.588744  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4137  response regulator receiver  41.35 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4505  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4619  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.167951  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4923  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4951  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710213  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8027  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.982767  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0485  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 208 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4917  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.29 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4967  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.29 
 
 		 220 aa  131  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103677  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4453  response regulator receiver  42.29 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3393  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1904  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0420846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4197  two component LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 230 aa  117  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1784  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000422915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  40.69 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  45.91 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.15 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2236  two-component LuxR family response regulator  36.1 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2990  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 234 aa  104  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2906  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.41 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  33.5 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0709  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 212 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  32.52 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  33.01 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  33.01 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  31.53 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  32.21 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  31.43 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5451  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761649  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.01 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 216 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2299  two component LuxR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4064  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.368666  normal  0.0789055 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 223 aa  98.2  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  35.47 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  31.4 
 
 		 216 aa  98.2  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  30.95 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  34.78 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  32.37 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  33.01 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  33.01 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  33.01 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  35.61 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.06 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>