227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5684 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5684  major intrinsic protein  100 
 
 		 233 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5724  major intrinsic protein  96.85 
 
 		 233 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4430  major intrinsic protein  62.45 
 
 		 232 aa  268  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4200  major intrinsic protein  63.11 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2336  major intrinsic protein  61.19 
 
 		 219 aa  257  9e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.28146  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  62.79 
 
 		 223 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2160  major intrinsic protein  58.52 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.606155  normal  0.559342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2245  major intrinsic protein  60.65 
 
 		 232 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.298454  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2417  major intrinsic protein  63.13 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.225064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2242  major intrinsic protein  62.18 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3398  major intrinsic protein  54.91 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3580  major intrinsic protein  55.4 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.960851 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3256  major intrinsic protein  54.46 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1819  major intrinsic protein  52.58 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5347  major intrinsic protein  53.05 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.735458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0223  major intrinsic protein  55.09 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05492  transmembrane ABC transporter protein  52.58 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63174  normal  0.752863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3541  major intrinsic protein  53.39 
 
 		 294 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.910121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5423  major intrinsic protein  50.43 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.597041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  51.71 
 
 		 453 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1447  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50 
 
 		 408 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.562915  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8608  major intrinsic protein  49.77 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal  0.402505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2215  major intrinsic protein  50.26 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0565  major intrinsic protein  44.39 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.228193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2326  major intrinsic protein  45.89 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3596  major intrinsic protein  42.17 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3274  major intrinsic protein  43.04 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1538  major intrinsic protein  36.62 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0304  MIP family channel protein  31.87 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1426  aquaporin Z  31.3 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1799  major intrinsic protein  42.27 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2984  MIP family channel protein  30.71 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.392184  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0174  aquaporin Z  30.81 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5705  aquaporin  30.54 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0161  aquaporin Z  30.81 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.418088  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  31 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  30.51 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0906  aquaporin Z  28.46 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  37.19 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  30.17 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  29.69 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0741  major intrinsic protein  39.6 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0791628  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002890  aquaporin Z  29.26 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2886  aquaporin Z  30.3 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000424459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3190  aquaporin Z  29.21 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  30.13 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  37.76 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  37.76 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  37.76 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5068  MIP family channel protein  37.76 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.71926  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  39 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5156  MIP family channel protein  37.76 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5447  MIP family channel protein  37.76 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03084  aquaporin Z  29.13 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  28.75 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  29.87 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  37.76 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  29.08 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  30.92 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  29.61 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2968  aquaporin Z  29.87 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0762473  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  34.82 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  34.46 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  35.35 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  29.29 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  33.78 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  29.29 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  28.76 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3443  aquaporin Z  29.29 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1676  aquaporin Z  29.29 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3864  aquaporin Z  29.29 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  29.29 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  29.29 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  27.59 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  29.11 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  30.41 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1006  hypothetical protein  34.9 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188387  normal  0.916441 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  30.41 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  27.9 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  29.61 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1922  MIP family channel protein  29.07 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.748219  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3651  aquaporin Z  28.95 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  30.13 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  29.24 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  31.1 
 
 		 247 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 331 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1194  MIP family channel protein  36.96 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  29.36 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  33.68 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  29.87 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  30.61 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  30.21 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0126  MIP family channel protein  28.93 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.840143  normal  0.0656822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  30.06 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  30.06 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  38.14 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  30.06 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  29.36 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6007  Aquaporin  29.45 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264936  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  32.23 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>