150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1713 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 240 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4810  hypothetical protein  75.71 
 
 		 230 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338459  hitchhiker  0.000318481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  51.07 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0389  protein of unknown function DUF541  55 
 
 		 239 aa  168  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0313  hypothetical protein  51.5 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  0.397901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4941  hypothetical protein  47.17 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.80121  hitchhiker  0.0000379681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  37.55 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2585  hypothetical protein  40.1 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  36.97 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  33.65 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  32.65 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  35.53 
 
 		 245 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  34.93 
 
 		 281 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  34.11 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  34.05 
 
 		 236 aa  95.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  35.71 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  31.22 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  33.5 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  34.93 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  32.6 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  31.14 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  28.45 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  28.98 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  31.15 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  35.14 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  33.03 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  35.89 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  29.11 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  33.65 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  33.01 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  29.44 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  31.7 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  34.36 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  32.38 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  29.72 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  29.39 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  29.39 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  29.39 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  27.1 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  28.98 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  29.03 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  33.98 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  28.98 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  28.63 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  27.88 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  33.64 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  33.64 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  30.48 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  31.07 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  31.73 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  27.93 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  27.93 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  27.93 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1584  putative lipoprotein  28.74 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000181169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  31.03 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  26.12 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  26.12 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  26.12 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  29.82 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  28.05 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  29.18 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  27.44 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  25.85 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  29.38 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  25.91 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1898  protein of unknown function DUF541  26.64 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.133706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  27.08 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  29.34 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  29.31 
 
 		 248 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  29.83 
 
 		 259 aa  62  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  32.86 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  29.31 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  29.31 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  28.34 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3926  hypothetical protein  28.85 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  29.31 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  23.18 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  29.31 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1341  protein of unknown function DUF541  26.11 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  26.73 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1123  hypothetical protein  27.01 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1158  protein of unknown function DUF541  27.44 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  25.87 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  25.75 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0620  protein of unknown function DUF541  28.57 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.276272 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  29.95 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  27.33 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3685  hypothetical protein  29.54 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  25.59 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  26.16 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3856  protein of unknown function DUF541  30.77 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0981  protein of unknown function DUF541  26.85 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal  0.525575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0373  hypothetical protein  26.8 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0711118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  26.69 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  24.9 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>