131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1433 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1433  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8770  response regulator receiver protein  83.33 
 
 		 138 aa  238  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.997367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0093  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3745  response regulator receiver domain-containing protein  32.54 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0861  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0503153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0388  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 793 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  32.76 
 
 		 812 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 548 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1228  response regulator receiver domain-containing protein  30.16 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000969205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2289  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3796  response regulator receiver  32.2 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.787937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4665  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1727  response regulator receiver  30.08 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0248964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2334  response regulator receiver  32.76 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0685092  normal  0.85818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2613  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.031456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7165  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.272897  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 743 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  31.01 
 
 		 573 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0516  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2634  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1391  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6328  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5091  response regulator receiver protein  29.92 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.947919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 943 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03240  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.13 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5033  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4811  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4830  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.071515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4573  response regulator receiver  29.13 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.546072 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 772 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4214  response regulator receiver protein  32.97 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4683  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 1651 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6764  putative two-component response regulator  31.46 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3363  response regulator receiver  35 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4296  response regulator receiver  35.48 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4331  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.095217 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  27.64 
 
 		 949 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4539  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 949 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  29.75 
 
 		 571 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1882  response regulator receiver  31.4 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4170  response regulator receiver  31.73 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 689 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.19 
 
 		 845 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 1631 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1475  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292646  normal  0.101486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6418  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1668  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.83 
 
 		 630 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 522 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0381782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 927 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 781 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 905 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 782 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2217  histidine kinase  27.42 
 
 		 396 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 		 686 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  29.84 
 
 		 872 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 705 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2569  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.929319 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 867 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 867 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  28.3 
 
 		 676 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 807 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  29.17 
 
 		 1036 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 589 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 589 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 766 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 		 1193 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 588 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5391  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2320  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.632565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3222  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 		 798 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.150716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 704 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1330  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 717 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  28.35 
 
 		 847 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 1019 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  28.93 
 
 		 529 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 		 1646 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  26.23 
 
 		 125 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3741  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 127 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 872 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 777 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2732  response regulator receiver protein  26.89 
 
 		 151 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 622 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 		 1022 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 789 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.19 
 
 		 1381 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 888 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 		 611 aa  40.8  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  29.27 
 
 		 646 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 		 618 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 		 611 aa  40.8  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 966 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 		 795 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  28.46 
 
 		 936 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4398  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0095  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>