More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4455 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  75.74 
 
 		 509 aa  812    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 509 aa  1043    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  33.9 
 
 		 520 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  33.4 
 
 		 509 aa  239  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  32.02 
 
 		 497 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 528 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 495 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  30.43 
 
 		 521 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.43 
 
 		 521 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  30.43 
 
 		 521 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 521 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  30.08 
 
 		 521 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  30.21 
 
 		 527 aa  196  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  30.22 
 
 		 531 aa  196  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.57 
 
 		 510 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 512 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 512 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 512 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  33.91 
 
 		 532 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  29.63 
 
 		 513 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 510 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.04 
 
 		 520 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  31.04 
 
 		 517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  30.6 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  30.66 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.94 
 
 		 534 aa  180  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 527 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 530 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  29.9 
 
 		 499 aa  177  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 510 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.61 
 
 		 525 aa  176  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  30.53 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  31.7 
 
 		 503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 533 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 520 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  29.98 
 
 		 507 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 528 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 515 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 519 aa  170  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 506 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 564 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 		 495 aa  168  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 510 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  26.67 
 
 		 512 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  26.67 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.9 
 
 		 492 aa  167  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 		 520 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  26.67 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  26.67 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.52 
 
 		 512 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30.42 
 
 		 509 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 510 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.52 
 
 		 512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  26.67 
 
 		 512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 		 514 aa  166  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.14 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.98 
 
 		 506 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3985  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 499 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5083  4-phytase  27.89 
 
 		 495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  27.96 
 
 		 537 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.33 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.33 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.27 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  26.13 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  28.24 
 
 		 520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  29.09 
 
 		 565 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4591  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 		 512 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  26.33 
 
 		 512 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  27.91 
 
 		 490 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 524 aa  163  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4103  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 		 502 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 520 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  27.96 
 
 		 537 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.68 
 
 		 513 aa  163  9e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000477414  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.01 
 
 		 502 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 549 aa  163  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.27 
 
 		 505 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.53 
 
 		 535 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 510 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2847  4-phytase  26.88 
 
 		 495 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.640082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.76 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>