More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3022 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  100 
 
 
521 aa  1068    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  52.8 
 
 
542 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  54.58 
 
 
650 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  52.01 
 
 
669 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  53.88 
 
 
663 aa  542  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  52.31 
 
 
667 aa  537  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  51.54 
 
 
522 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  51.64 
 
 
663 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  51.82 
 
 
673 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  51.54 
 
 
666 aa  512  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  48.94 
 
 
527 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  50.29 
 
 
667 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  48.42 
 
 
516 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  50.39 
 
 
648 aa  491  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  49.61 
 
 
670 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  48.07 
 
 
663 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  49.51 
 
 
633 aa  488  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  47.83 
 
 
646 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  46.73 
 
 
524 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  47.93 
 
 
660 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  47.93 
 
 
660 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  49.41 
 
 
526 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  49.41 
 
 
526 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  47.84 
 
 
660 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  46.71 
 
 
660 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  42.47 
 
 
529 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  40.9 
 
 
531 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  40.7 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  40.63 
 
 
531 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  40.7 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  40.7 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  40.7 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  40.43 
 
 
531 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  40.43 
 
 
531 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  40.43 
 
 
531 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  40.63 
 
 
531 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  40.63 
 
 
531 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  40.43 
 
 
531 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  40.7 
 
 
531 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  40.43 
 
 
531 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  42.72 
 
 
526 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  48.26 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  42.47 
 
 
523 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  43.76 
 
 
539 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  42.8 
 
 
520 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  42.25 
 
 
532 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  41.8 
 
 
554 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  41.25 
 
 
553 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  43.4 
 
 
533 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  43.02 
 
 
533 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  42.26 
 
 
537 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  39.46 
 
 
532 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  41.8 
 
 
554 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  42.09 
 
 
509 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  43.02 
 
 
539 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  43.36 
 
 
557 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  41.96 
 
 
513 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  39.81 
 
 
530 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  38.57 
 
 
520 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  38.57 
 
 
520 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  40.11 
 
 
547 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  41.96 
 
 
513 aa  362  9e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  38.18 
 
 
531 aa  362  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  41.76 
 
 
513 aa  360  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  41.57 
 
 
513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  41.57 
 
 
513 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  41.57 
 
 
513 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  40.04 
 
 
544 aa  353  5e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  39.01 
 
 
523 aa  350  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  39.46 
 
 
522 aa  348  9e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  39.12 
 
 
522 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  38.74 
 
 
542 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  39.05 
 
 
526 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  37.62 
 
 
544 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  36.87 
 
 
508 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  37.04 
 
 
543 aa  299  8e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  35.07 
 
 
543 aa  291  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  27.68 
 
 
448 aa  93.2  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  25.71 
 
 
463 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  24.49 
 
 
561 aa  80.9  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  27.78 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.75 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  24.73 
 
 
505 aa  78.2  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  25 
 
 
511 aa  76.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.58 
 
 
217 aa  76.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  26.58 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.49 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1458  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.03 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  25.63 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.48 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0128919  normal  0.171339 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  24.36 
 
 
439 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  26.86 
 
 
232 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.22 
 
 
217 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  26.45 
 
 
233 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.42 
 
 
219 aa  72.4  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.77 
 
 
237 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3950  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.06 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.48 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.02 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0829  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.13 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.201615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>