More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1973 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
311 aa  630  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  41.6 
 
 
288 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  34.93 
 
 
286 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  32.21 
 
 
331 aa  135  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  35.02 
 
 
296 aa  125  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  33.46 
 
 
260 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  33.33 
 
 
261 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  32.35 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  32.6 
 
 
263 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  32.97 
 
 
262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  32.97 
 
 
261 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  32.23 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  31.5 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  32.13 
 
 
270 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  32.05 
 
 
264 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  31.32 
 
 
270 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  30.86 
 
 
271 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  30.71 
 
 
270 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  30.86 
 
 
271 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  30.71 
 
 
270 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  29.39 
 
 
261 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  29.39 
 
 
261 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  29.86 
 
 
270 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  30.6 
 
 
270 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  30.11 
 
 
270 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  44.62 
 
 
269 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  30.71 
 
 
269 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 
537 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  43.4 
 
 
217 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  43.81 
 
 
217 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 
223 aa  93.2  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  41.96 
 
 
320 aa  92.4  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.14 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  43.4 
 
 
266 aa  90.1  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
1026 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  44.14 
 
 
330 aa  89.7  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 
525 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 
231 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  42.57 
 
 
229 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  40 
 
 
214 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  47.22 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 
440 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 
224 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 
229 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  44.17 
 
 
429 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 
229 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  43.93 
 
 
402 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  46.08 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  34.46 
 
 
236 aa  85.9  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 
205 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
230 aa  86.3  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  40.74 
 
 
222 aa  85.9  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  38.39 
 
 
318 aa  85.9  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  43 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 
215 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  40.59 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  41.44 
 
 
694 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 
224 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  47.73 
 
 
224 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  39.05 
 
 
222 aa  84  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.32 
 
 
248 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  32.82 
 
 
215 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  38.24 
 
 
217 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.37 
 
 
707 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.46 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  38.94 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  34.97 
 
 
228 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  43.56 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.81 
 
 
230 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  34.97 
 
 
228 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  44.66 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  32.31 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  36.72 
 
 
641 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  41 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.57 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 
498 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  38.1 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  41.35 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  36.84 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  40 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 
543 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 
434 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>