278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3461 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
179 aa  358  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.71 
 
 
186 aa  120  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.14 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.14 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  36 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  32.96 
 
 
179 aa  117  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
186 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  36.57 
 
 
201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.66 
 
 
186 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.57 
 
 
188 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
193 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.86 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  36 
 
 
186 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  35.84 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
180 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.43 
 
 
188 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
180 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  35.26 
 
 
190 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
180 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  36 
 
 
194 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  35.26 
 
 
217 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  35.47 
 
 
179 aa  102  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 
180 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.56 
 
 
180 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
180 aa  101  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
186 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  32 
 
 
190 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
189 aa  99  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
179 aa  99  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  32.37 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.53 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  32.57 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  31.82 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
182 aa  92  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 
183 aa  91.3  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
179 aa  90.9  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  32.95 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.21 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
179 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  32.2 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
182 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  33.73 
 
 
179 aa  85.5  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.93 
 
 
192 aa  84.7  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  33.52 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.27 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  31.46 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  31.4 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  30.68 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  30.86 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  31.07 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  28.9 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.44 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  29.21 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.11 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  28.57 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.99 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.59 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  29.94 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  26.09 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  27.01 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  24.14 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.89 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  25.71 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>