63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0585 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0585  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 537 aa  1098    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976376 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  28.11 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  27.4 
 
 		 510 aa  186  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  26.98 
 
 		 514 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  24.8 
 
 		 528 aa  170  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02600  chain length determinant family protein  25.14 
 
 		 519 aa  163  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.283305  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  26.81 
 
 		 518 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  23.75 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  26.31 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  25.76 
 
 		 503 aa  144  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  25.99 
 
 		 524 aa  143  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  24.24 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  24.9 
 
 		 532 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  25.49 
 
 		 480 aa  127  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  24.06 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  25.44 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1507  lipopolysaccharide biosynthesis  28.71 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.577803  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  22.54 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1927  lipopolysaccharide biosynthesis  23.46 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.3 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  21.11 
 
 		 518 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  21.74 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.54 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.2 
 
 		 750 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  21.55 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  21.31 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  19.2 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.4 
 
 		 520 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 778 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 477 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  21.26 
 
 		 519 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  21.29 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  21.93 
 
 		 499 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 		 575 aa  54.7  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  20.42 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  21.81 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  21.17 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  23.92 
 
 		 736 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  20.72 
 
 		 490 aa  51.2  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  21.66 
 
 		 753 aa  50.4  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  21.62 
 
 		 734 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  31.43 
 
 		 232 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  21.39 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  31.43 
 
 		 232 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 477 aa  47.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0298  hypothetical protein  21.46 
 
 		 499 aa  47.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  20.11 
 
 		 790 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 		 520 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 643 aa  47  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.72 
 
 		 642 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.01 
 
 		 730 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 735 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4163  lipopolysaccharide biosynthesis  23.38 
 
 		 748 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214287  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4203  lipopolysaccharide biosynthesis  23.38 
 
 		 748 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 734 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 734 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1529  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 499 aa  44.3  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417351  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  20.04 
 
 		 742 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  27.63 
 
 		 500 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.66 
 
 		 653 aa  43.9  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 		 464 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>