79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1269 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 208 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  87.98 
 
 		 208 aa  363  1e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  86.06 
 
 		 208 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  31.46 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.67 
 
 		 274 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.67 
 
 		 274 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2757  nickel/cobalt efflux protein RcnA  25.33 
 
 		 253 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437042 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  28.99 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  25.86 
 
 		 282 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4186  high-affinity nickel-transporter  28.31 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.898431  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1551  high-affinity nickel-transporter  23.92 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1541  nickel/cobalt efflux protein RcnA  23.92 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  27.32 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0937  nickel/cobalt efflux protein RcnA  23.53 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.49714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  23.53 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.790199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2769  high-affinity nickel-transporter  38.71 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0085  high-affinity nickel-transporter  35.63 
 
 		 371 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  28.65 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3358  nickel/cobalt efflux protein RcnA  30.39 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  30.19 
 
 		 447 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3242  nickel/cobalt efflux protein RcnA  30.93 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0110121 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  27.32 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  25.65 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  32.61 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4280  hypothetical protein  29.17 
 
 		 292 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03927  hypothetical protein  31.82 
 
 		 377 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0559  high-affinity nickel-transporter  30.43 
 
 		 398 aa  61.6  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2775  high-affinity nickel-transporter  24.02 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  29.17 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1910  high-affinity nickel-transporter  40.32 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2243  high-affinity nickel-transporter  31.25 
 
 		 375 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2493  high-affinity nickel-transporter  25.96 
 
 		 373 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  31.25 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3089  nickel/cobalt efflux protein RcnA  26.09 
 
 		 285 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3645  hypothetical protein  27.1 
 
 		 354 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4769  high-affinity nickel-transporter  28.4 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3988  high-affinity nickel-transporter  31.87 
 
 		 501 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000233692  normal  0.178038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2647  high-affinity nickel-transporter  27.27 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  23.01 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  29.89 
 
 		 371 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0285  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  26.52 
 
 		 366 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0371568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3585  high-affinity nickel-transporter  36.96 
 
 		 506 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.83596  normal  0.321001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  20.91 
 
 		 372 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  23.35 
 
 		 319 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3402  high-affinity nickel-transporter  39.66 
 
 		 390 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  25.12 
 
 		 328 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  24.64 
 
 		 328 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  29.94 
 
 		 293 aa  51.6  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2759  high-affinity nickel-transporter  24.05 
 
 		 351 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1132  nickel/cobalt efflux system RcnA  38.46 
 
 		 80 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  26.89 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  25.52 
 
 		 328 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001366  ABC-type uncharacterized transport system permease component  36.96 
 
 		 323 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.954094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  24.42 
 
 		 376 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2245  high-affinity nickel-transporter  25.39 
 
 		 330 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  25 
 
 		 328 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  25 
 
 		 328 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  37.04 
 
 		 376 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3677  high-affinity nickel-transporter  28.95 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.841534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3506  high-affinity nickel-transporter  35.19 
 
 		 372 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0849  nickel/cobalt efflux system RcnA  35.87 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  25.7 
 
 		 340 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  25.7 
 
 		 340 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  25.7 
 
 		 340 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0588  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.81 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  25.33 
 
 		 345 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6802  high-affinity nickel-transporter  31 
 
 		 543 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2976  high-affinity nickel-transporter  21.6 
 
 		 342 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0088  hypothetical protein  28.72 
 
 		 360 aa  45.1  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3692  high-affinity nickel-transporter  30.85 
 
 		 358 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3041  high-affinity nickel-transporter  22.03 
 
 		 357 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.167253  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4249  high-affinity nickel-transporter  29.79 
 
 		 367 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0096  hypothetical protein  28.72 
 
 		 367 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  29 
 
 		 359 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3393  high-affinity nickel-transporter  26.67 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0166136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  21.65 
 
 		 374 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1234  high-affinity nickel-transporter  22.91 
 
 		 357 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1398  high-affinity nickel-transporter  20.69 
 
 		 337 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0677472  normal  0.0633291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2905  high-affinity nickel-transporter  40.91 
 
 		 381 aa  41.6  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>