More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2934 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2934  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 329 aa  677    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2862  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.486548  normal  0.303409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0232  transcriptional regulator, LysR family  27.88 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0952  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0893  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 308 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3293  hypothetical protein  28.52 
 
 		 312 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1403  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1089  LysR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0835  transcriptional regulator LysR family  28.33 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  27.15 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 301 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 301 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2454  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.262838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4610  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1511  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1452  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0384  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0197813 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 307 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3202  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 294 aa  96.3  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.276424  normal  0.7211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  27.02 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  27.02 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0417  transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234573  hitchhiker  0.000746298 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0980  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  40.94 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  40.16 
 
 		 298 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2169  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1027  transcriptional regulator, LysR family  26.61 
 
 		 296 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.781525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1247  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 298 aa  93.2  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329564  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2881  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 298 aa  92.8  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3855  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 347 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0669759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2754  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1915  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.36 
 
 		 281 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0562  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00274587  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1119  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 301 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0706  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265048  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0492  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0963862 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1517  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000321062  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3839  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1158  LysR substrate-binding  26.23 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6115  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.56 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1317  transcriptional regulator, LysR family  25.76 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2899  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5011  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0895  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.163696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2111  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0551561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3868  transcriptional regulator, LysR family  27.49 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0055  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3400  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000882722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0552  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0937  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1665  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1750  transcriptional regulator, LysR family  25.25 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1560  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.987371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2147  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576835 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3932  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1449  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1498  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.06 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  25.75 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1390  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1163  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0513679  normal  0.0450168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3247  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2722  transcriptional regulator, LysR family  25.6 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6804  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.761993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3003  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.209917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2557  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2175  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.823288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3972  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8528  transcriptional regulator, LysR family  25.16 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  25.94 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3141  transcriptional regulator LysR family  25.2 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2983  transcriptional regulator, LysR family  25.6 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0899022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3570  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 331 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0645884  normal  0.187476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>