More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2334 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2334  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000924043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  40.46 
 
 		 174 aa  92  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  42.34 
 
 		 123 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  39.06 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  39.06 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  36.17 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  36.76 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  36.76 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  29.45 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  46.3 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  34.92 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  36.84 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  31.94 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  36.52 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  30.71 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.57 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  36.84 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.93 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2231  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  33.05 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  35.07 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  34.76 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  34.62 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2611  lipoprotein signal peptidase  43.12 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  32.87 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  33.83 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  32.54 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  31.94 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  34.33 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  32.56 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  32.64 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  32.62 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  38.32 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  32.92 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  33.04 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  30.25 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  35.48 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  36.21 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  36.43 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  33.91 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  34.11 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  36.28 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  30.99 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  36.28 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  36.28 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  36.28 
 
 		 171 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 163 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25760  lipoprotein signal peptidase  38.17 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  39.5 
 
 		 165 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  34.84 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.57 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4477  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4308  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.114922  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4208  lipoprotein signal peptidase  35.77 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  30.41 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  33.85 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  27.46 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  29.94 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  32.81 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  30.88 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  31.69 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  30.71 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  40.91 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0481  signal peptidase II  31.25 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  29.8 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>