More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2104 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2104  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  40 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1136  regulatory protein, LuxR  39.47 
 
 		 868 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  37.84 
 
 		 916 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  37 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.66 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 471 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  41.67 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1373  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.26 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 514 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.13 
 
 		 914 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.68 
 
 		 894 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 514 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 496 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 496 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.34 
 
 		 913 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  32.53 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.59 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.58 
 
 		 1019 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  37 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  31.68 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.32 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 967 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 910 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0253  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  36.71 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  36.71 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 492 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.94 
 
 		 911 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  41.18 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2614  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003098  BarA-associated response regulator UvrY  36.71 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000268807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  39.19 
 
 		 873 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  37.97 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  52  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  41.54 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.06 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 454 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1518.1  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000399536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0560  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 514 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0851  DNA-binding response regulator  34.34 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2085  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.844485  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  36.76 
 
 		 921 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  36.71 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 905 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.98 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3832  regulatory protein, LuxR  44.64 
 
 		 1336 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196603  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.74 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  36.71 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 907 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  29.23 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0766  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  30.39 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  36.71 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 907 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  42.62 
 
 		 905 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>