114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1501 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1501  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 362 aa  712    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1669  FAD dependent oxidoreductase  37.86 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1765  hypothetical protein  33.43 
 
 		 372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5749  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 356 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3588  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 354 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00745  hypothetical protein  26.38 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1216  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000550481 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0920  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0105145  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3234  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  26.38 
 
 		 357 aa  140  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1858  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20537  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0786  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.766531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0783  putative FAD dependent oxidoreductase  19.12 
 
 		 355 aa  99.4  9e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4213  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.1387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  22.65 
 
 		 690 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2155  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)-like protein  26.4 
 
 		 604 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.195632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2100  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.258817  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1494  hypothetical protein  24.48 
 
 		 666 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.03 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1489  hypothetical protein  24.23 
 
 		 666 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2872  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.33 
 
 		 666 aa  60.8  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  0.0703666 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2586  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.3 
 
 		 675 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3808  hypothetical protein  21.92 
 
 		 682 aa  60.1  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.92 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1358  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.73 
 
 		 672 aa  59.7  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0608182  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.07 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.37 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1343  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.9 
 
 		 654 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.73 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1458  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.76 
 
 		 675 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1070  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.73 
 
 		 680 aa  52.8  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.388206  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  24.93 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.65 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  32.64 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  25 
 
 		 631 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.78 
 
 		 644 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3384  hypothetical protein  27.46 
 
 		 705 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.65 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10140  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.86 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.19 
 
 		 655 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  23.59 
 
 		 699 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0372  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.21 
 
 		 689 aa  50.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000353518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.21 
 
 		 689 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.47 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  24.01 
 
 		 367 aa  49.7  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  25.33 
 
 		 374 aa  49.7  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1410  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.21 
 
 		 689 aa  49.7  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000203784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.16 
 
 		 675 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2621  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.32 
 
 		 666 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350397 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1920  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.145777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  25.75 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  23.68 
 
 		 668 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1964  hypothetical protein  30.81 
 
 		 653 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1989  hypothetical protein  35.96 
 
 		 739 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136918 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.42 
 
 		 668 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2732  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.32 
 
 		 666 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  23.06 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.07 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.07 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  23.68 
 
 		 668 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  22.79 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.58 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.86 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  25.36 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.58 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.24 
 
 		 666 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.86 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.04 
 
 		 660 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  23.37 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  32.73 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  24.79 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3932  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.45 
 
 		 656 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2568  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.24 
 
 		 666 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.580805  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  29.01 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1694  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.26 
 
 		 674 aa  47  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00252388  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1390  hypothetical protein  25.39 
 
 		 622 aa  46.6  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  23.56 
 
 		 668 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.56 
 
 		 668 aa  46.2  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2608  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.24 
 
 		 666 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 365 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  32.39 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002869  5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme MnmC  23.08 
 
 		 672 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103068  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.56 
 
 		 668 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.1 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.56 
 
 		 668 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  27.75 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  22.7 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.83 
 
 		 653 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  22.7 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.58 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  22.97 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  22.7 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  28.65 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  28.99 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  30.99 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1076  protein of unknown function DUF752  29.01 
 
 		 619 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.506712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>