80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0127 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  823    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  46.08 
 
 
412 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  35.79 
 
 
695 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  34.03 
 
 
383 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  31.6 
 
 
404 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  30.56 
 
 
404 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  27.88 
 
 
418 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  31.56 
 
 
339 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  28.57 
 
 
393 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  25.89 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  25.61 
 
 
385 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  28.07 
 
 
467 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  25.84 
 
 
390 aa  100  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  24.68 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  27 
 
 
386 aa  90.1  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  26.69 
 
 
440 aa  89.7  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  26.47 
 
 
391 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  24.93 
 
 
427 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  22.44 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  27.72 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  24.86 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  36.69 
 
 
525 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  23.62 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  23.45 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  25.75 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  24.82 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  25.09 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  23.17 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  27.71 
 
 
333 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.24 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  28.89 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8506  hypothetical protein  29.5 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  25.96 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  28.24 
 
 
322 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  23.51 
 
 
356 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  23.51 
 
 
356 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.53 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  22.5 
 
 
334 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  20.38 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  25.98 
 
 
434 aa  60.1  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  23.87 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  23.32 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  23.53 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  20 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  20 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  20 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  23.93 
 
 
405 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  23.65 
 
 
405 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  24.78 
 
 
753 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  23.91 
 
 
355 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  20 
 
 
387 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.77 
 
 
343 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.8 
 
 
322 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  25.45 
 
 
426 aa  53.1  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  30.6 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  24.91 
 
 
351 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  24.02 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  27.24 
 
 
734 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  22.01 
 
 
400 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  20.78 
 
 
327 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4422  hypothetical protein  21.7 
 
 
340 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  23.68 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  21.93 
 
 
408 aa  47.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2647  hypothetical protein  23.91 
 
 
308 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2127  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.39 
 
 
1086 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0243  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  23.1 
 
 
558 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  26.37 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  26.11 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  26.32 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2232  carbamoyl phosphate synthase large subunit  31.68 
 
 
1079 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  23.83 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.33 
 
 
302 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.43 
 
 
267 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  21.49 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0916  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.52 
 
 
1038 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.150361 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  25.69 
 
 
312 aa  43.9  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10656  conserved hypothetical protein  25 
 
 
795 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.426942  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  18.92 
 
 
391 aa  43.5  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  25.12 
 
 
354 aa  43.1  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  21.86 
 
 
443 aa  43.1  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>