More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5232 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  53.67 
 
 
742 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  100 
 
 
732 aa  1422    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  46.42 
 
 
728 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  46.13 
 
 
832 aa  515  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  46.99 
 
 
737 aa  513  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  45.85 
 
 
735 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  44.89 
 
 
735 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  45.5 
 
 
755 aa  485  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  42.63 
 
 
787 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  45.78 
 
 
724 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  44.03 
 
 
731 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  44.75 
 
 
734 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  44.28 
 
 
793 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  40.89 
 
 
779 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  43.78 
 
 
723 aa  452  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  43.84 
 
 
734 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  39.67 
 
 
779 aa  452  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  41.96 
 
 
909 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  38.74 
 
 
772 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  38.74 
 
 
772 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  38.74 
 
 
772 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  35.69 
 
 
829 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  35.69 
 
 
829 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  37.65 
 
 
920 aa  422  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  40.84 
 
 
917 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  38.58 
 
 
743 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  41.72 
 
 
1002 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  42.08 
 
 
734 aa  399  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  40.71 
 
 
729 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  38.66 
 
 
842 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  34.89 
 
 
893 aa  391  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  38.68 
 
 
732 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  41.9 
 
 
843 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  38.8 
 
 
787 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  38.84 
 
 
876 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.38 
 
 
746 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  43.07 
 
 
726 aa  379  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  38.3 
 
 
784 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  37.59 
 
 
735 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  40.03 
 
 
1058 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  40.71 
 
 
903 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  40.43 
 
 
1092 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  34.72 
 
 
704 aa  369  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  35.62 
 
 
735 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  41.77 
 
 
840 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  37.64 
 
 
791 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  40.19 
 
 
854 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  36.1 
 
 
729 aa  365  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.24 
 
 
1382 aa  365  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.94 
 
 
737 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  37.16 
 
 
751 aa  359  8e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  35.62 
 
 
760 aa  356  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  40.2 
 
 
958 aa  353  7e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  36.65 
 
 
717 aa  352  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  41.18 
 
 
738 aa  351  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.93 
 
 
752 aa  348  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  35.82 
 
 
718 aa  347  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  35.88 
 
 
715 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  35.62 
 
 
749 aa  341  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  40.23 
 
 
903 aa  336  9e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  36.24 
 
 
723 aa  334  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  40.25 
 
 
732 aa  332  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  38.89 
 
 
714 aa  331  4e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  37.53 
 
 
726 aa  329  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  34.57 
 
 
758 aa  324  4e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  38.4 
 
 
807 aa  323  9.000000000000001e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  41.31 
 
 
726 aa  321  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.92 
 
 
796 aa  320  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  34.21 
 
 
740 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  35.65 
 
 
711 aa  306  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  38.29 
 
 
737 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  37.78 
 
 
724 aa  303  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  34.08 
 
 
750 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  32.82 
 
 
781 aa  287  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  35.48 
 
 
761 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  35.67 
 
 
836 aa  273  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  36.58 
 
 
743 aa  269  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.36 
 
 
979 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.23 
 
 
983 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.23 
 
 
983 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.77 
 
 
758 aa  250  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  35.22 
 
 
734 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  31.59 
 
 
978 aa  232  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  30.94 
 
 
710 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  32.97 
 
 
968 aa  227  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.78 
 
 
741 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  31.38 
 
 
741 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.68 
 
 
966 aa  217  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.45 
 
 
743 aa  207  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  25.6 
 
 
730 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  25.6 
 
 
730 aa  206  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  25.6 
 
 
730 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  26.47 
 
 
730 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  25.98 
 
 
730 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  30.09 
 
 
766 aa  205  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.69 
 
 
743 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  25.46 
 
 
730 aa  204  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  25.46 
 
 
730 aa  204  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  25.39 
 
 
730 aa  204  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  25.46 
 
 
730 aa  204  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>