60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1637 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  31.3 
 
 
342 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  32.31 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  33.7 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1794  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00170146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  30.68 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1773  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0201195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0122  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000708393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1773  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0358765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1043  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1948  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000693981  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5414  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1285  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0393543  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  28.95 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.87 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  31.66 
 
 
311 aa  75.5  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2537  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  31.18 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
295 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1727  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000433623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2157  hypothetical protein  30.22 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  0.0292686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  30.67 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.45 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1502  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000236519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1046  tetratricopeptide TPR_2  28.4 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1526  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40396  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  32.52 
 
 
305 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  29.7 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.18 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.18 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.17 
 
 
689 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4666  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  28.4 
 
 
275 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988456  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0075  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
237 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657959  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.77 
 
 
810 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 
927 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
878 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  27.2 
 
 
395 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
639 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.47 
 
 
632 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
643 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.07 
 
 
626 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
587 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.07 
 
 
614 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.07 
 
 
614 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
614 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.07 
 
 
626 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
614 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
614 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
612 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3509  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 
231 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.697932  normal  0.144204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
620 aa  42  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
565 aa  42  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
636 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
295 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>