More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2757 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  99.56 
 
 		 456 aa  925    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  93.19 
 
 		 456 aa  840    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  71.88 
 
 		 470 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  85.31 
 
 		 453 aa  770    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  82.34 
 
 		 453 aa  746    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  928    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  80.48 
 
 		 455 aa  731    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  66.3 
 
 		 453 aa  617  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  68.28 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  62.86 
 
 		 461 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  59.33 
 
 		 455 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  55.26 
 
 		 452 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  51.47 
 
 		 452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  48.42 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  29.82 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  32.75 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  29.51 
 
 		 473 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  31.46 
 
 		 446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  32.28 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  32.28 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  29.74 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  27.93 
 
 		 440 aa  156  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  34.01 
 
 		 543 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  31.56 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  28.27 
 
 		 458 aa  153  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  28.37 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  31.25 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  32.86 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  35.64 
 
 		 558 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  27.85 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  34.46 
 
 		 473 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  34.82 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  31.59 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  30.81 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  33.67 
 
 		 485 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  30.57 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  28.4 
 
 		 476 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  32.18 
 
 		 483 aa  146  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  33.96 
 
 		 475 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  28.47 
 
 		 440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  34.65 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.7 
 
 		 549 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  31.13 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  29.2 
 
 		 448 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  34.33 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  30.31 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  34.33 
 
 		 445 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  34.33 
 
 		 445 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  29.22 
 
 		 440 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  34.53 
 
 		 481 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  33.98 
 
 		 436 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  28.89 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  34.32 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  28.29 
 
 		 564 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  32.45 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  33.44 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  28.35 
 
 		 477 aa  140  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  30.13 
 
 		 464 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  31.89 
 
 		 470 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  29.57 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  33.78 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  28.67 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6435  ABC-1 domain protein  28.22 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  33.22 
 
 		 556 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  33.33 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  28.85 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  30.25 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  31.82 
 
 		 454 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  29.37 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  28.7 
 
 		 451 aa  136  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  31.79 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  30.94 
 
 		 588 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  27.52 
 
 		 558 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  30.02 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  26.78 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  32.71 
 
 		 583 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  29.47 
 
 		 432 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  29.97 
 
 		 517 aa  133  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  27.51 
 
 		 558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  33.21 
 
 		 559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  25.24 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  32.89 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  23.58 
 
 		 434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  33.45 
 
 		 566 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80246  mitochondrial chaperone  28.16 
 
 		 560 aa  130  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.763396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  29.73 
 
 		 563 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  28.2 
 
 		 537 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  30.58 
 
 		 599 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  31.95 
 
 		 553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  33.12 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  32.33 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  27.36 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  31.23 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  30.55 
 
 		 547 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  33.67 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.75 
 
 		 554 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  27.42 
 
 		 537 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  32.67 
 
 		 565 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  34.78 
 
 		 557 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>