288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1136 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  78.65 
 
 		 384 aa  638    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  100 
 
 		 384 aa  788    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  78.65 
 
 		 384 aa  637    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  78.39 
 
 		 384 aa  637    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  65.04 
 
 		 390 aa  537  1e-151  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  42.89 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  45.5 
 
 		 379 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  43.54 
 
 		 395 aa  308  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  41.55 
 
 		 365 aa  275  8e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  39.95 
 
 		 363 aa  272  6e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  41.08 
 
 		 365 aa  269  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  41.22 
 
 		 365 aa  263  4e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  39.69 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  39.53 
 
 		 374 aa  255  9e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  39.03 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  36.69 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  39.34 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2743  L-tyrosine decarboxylase  35.96 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0591  L-tyrosine decarboxylase  37.29 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146124  normal  0.883082 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2995  L-tyrosine decarboxylase  35.67 
 
 		 349 aa  209  5e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1500  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.04 
 
 		 500 aa  139  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.112242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.2 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0806  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.54 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.97 
 
 		 498 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1873  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.03 
 
 		 472 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.044289  normal  0.812242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2190  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.76 
 
 		 474 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01989  conserved hypothetical protein similar to dihydrosphingosine phosphate lyase (Eurofung)  27.73 
 
 		 572 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.108973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2562  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.75 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000400331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3961  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.71 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3373  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.75 
 
 		 494 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0563875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3073  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.87 
 
 		 514 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.441347  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119543  Sphingosine-1-phosphate lyase  29.64 
 
 		 532 aa  116  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1072  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.48 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1139  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  27.78 
 
 		 473 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.428342  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.96 
 
 		 549 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2756  sphingosine-1-phosphate lyase  29.24 
 
 		 473 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.9 
 
 		 549 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2597  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.68 
 
 		 498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.57 
 
 		 549 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.65 
 
 		 549 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.65 
 
 		 549 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.51 
 
 		 548 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.24 
 
 		 549 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2912  sphingosine-1-phosphate lyase  28.95 
 
 		 473 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0389716  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0311  sphingosine-1-phosphate lyase  28.1 
 
 		 473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0935746  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87778  dihydrosphingosine-1-phosphate lyase  28.35 
 
 		 603 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3028  histidine decarboxylase  27.58 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.726503  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.65 
 
 		 549 aa  110  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.3 
 
 		 560 aa  109  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.65 
 
 		 549 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.43 
 
 		 551 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00560  sphinganine-1-phosphate aldolase, putative  28.85 
 
 		 546 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2761  sphingosine-1-phosphate lyase  27.59 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2918  sphingosine-1-phosphate lyase  28.03 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1143  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  27.59 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764219  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15730  predicted protein  28.16 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0024811  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0309  sphingosine-1-phosphate lyase  25.64 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  28.57 
 
 		 533 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.76 
 
 		 554 aa  106  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0159  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.81 
 
 		 513 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3418  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.43 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.62 
 
 		 552 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.52 
 
 		 546 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.83 
 
 		 550 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  26.91 
 
 		 543 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.45 
 
 		 546 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  26.62 
 
 		 548 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0389  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.86 
 
 		 499 aa  99.8  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22660  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  27.81 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  25.32 
 
 		 472 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.96 
 
 		 552 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  24.5 
 
 		 548 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0981  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.35 
 
 		 541 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.95 
 
 		 538 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  26.62 
 
 		 548 aa  93.6  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.11 
 
 		 547 aa  93.2  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0451  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.53 
 
 		 425 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2128  hypothetical protein  27.21 
 
 		 605 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2102  hypothetical protein  27.37 
 
 		 605 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.75 
 
 		 567 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6749  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.89 
 
 		 574 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.22 
 
 		 611 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3931  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.34 
 
 		 536 aa  90.5  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0304  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.57 
 
 		 581 aa  89.4  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0782914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3997  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.51 
 
 		 516 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  24.76 
 
 		 552 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.23 
 
 		 475 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.77 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.67 
 
 		 529 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1766  glutamate decarboxylase  31 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2744  glutamate decarboxylase  24.07 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0749502  hitchhiker  0.000505067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03552  Glutamate decarboxylase putative  25.35 
 
 		 544 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.37 
 
 		 550 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.77 
 
 		 466 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03700  glutamate decarboxylase, putative  25.95 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03700  glutamate decarboxylase, putative  25.95 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.97 
 
 		 573 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.72 
 
 		 477 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26.46 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05447  hypothetical glutamic acid decarboxylase (Eurofung)  24.58 
 
 		 515 aa  80.1  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  0.629944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>