More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2311 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
242 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  34.02 
 
 
243 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  34.02 
 
 
243 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 
243 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 
240 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  35.68 
 
 
240 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 
244 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
231 aa  109  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  27.2 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 
245 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 
246 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
228 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
243 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  27.94 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  27.02 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  25.42 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  27.46 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.37 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.37 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  30.37 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  30.37 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.37 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.37 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.37 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  30.37 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
239 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  31.05 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  30.21 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
239 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
239 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
239 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  28.99 
 
 
243 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  26.5 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  27.75 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  26.1 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  24.79 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  27.81 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  29.69 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  29.69 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  26.1 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1266  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.86 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00315864  hitchhiker  0.00193945 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1730  transcriptional regulator, LuxR family  24.35 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000557622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  26.42 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  25.73 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.35 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.86 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.86 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1442  transcriptional regulator, LuxR family  23.97 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2112  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.95 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.722664  hitchhiker  0.0000000000000595752 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.38 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2165  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.95 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0921825  hitchhiker  0.00000020452 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.38 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.38 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1170  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.95 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0141324  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.38 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.38 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.38 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.38 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1293  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.95 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  hitchhiker  0.0000202879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2150  DNA-binding transcriptional activator SdiA  23.78 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1044  DNA-binding transcriptional activator SdiA  23.78 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000369866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2106  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.95 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  29.57 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.65 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  25.65 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.73 
 
 
240 aa  62.4  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  25.5 
 
 
236 aa  62  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4428  transcriptional regulator, LuxR family  24.39 
 
 
245 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  26.32 
 
 
301 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5493  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  26.96 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5910  LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0531603  decreased coverage  0.00148471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1815  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.319475  normal  0.33301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1935  LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0226826  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>