More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1928 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  72.18 
 
 
436 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
441 aa  905    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  68.52 
 
 
435 aa  622  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  66.43 
 
 
437 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  69.76 
 
 
443 aa  585  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  65.57 
 
 
428 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  65.57 
 
 
428 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  65.57 
 
 
428 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  64.14 
 
 
441 aa  574  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  64.37 
 
 
441 aa  568  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  65.26 
 
 
443 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  66.51 
 
 
430 aa  567  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  63.89 
 
 
435 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  62.04 
 
 
436 aa  552  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  62.5 
 
 
429 aa  528  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  54.42 
 
 
439 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  52.36 
 
 
438 aa  455  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  56.09 
 
 
444 aa  457  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  47.85 
 
 
432 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  44.66 
 
 
428 aa  354  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  44.73 
 
 
435 aa  353  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  45.31 
 
 
436 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  44.5 
 
 
435 aa  343  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  42.92 
 
 
437 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  43.87 
 
 
424 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  40.69 
 
 
436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  41.01 
 
 
431 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  39.75 
 
 
431 aa  280  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  40.15 
 
 
431 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0247  histidinol dehydrogenase  41.71 
 
 
444 aa  277  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  40.94 
 
 
426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  38.21 
 
 
426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  38.39 
 
 
429 aa  273  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  37.75 
 
 
429 aa  272  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 
431 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  39.46 
 
 
430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4350  histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 
447 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376502  normal  0.174658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  39.36 
 
 
432 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 
429 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 
429 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  37.28 
 
 
433 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  40.8 
 
 
434 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 
429 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 
429 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2920  histidinol dehydrogenase  40.97 
 
 
429 aa  264  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  37.5 
 
 
429 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  38.57 
 
 
431 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3070  Histidinol dehydrogenase  40.59 
 
 
433 aa  263  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  39.85 
 
 
431 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4279  histidinol dehydrogenase  39.95 
 
 
441 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0461088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  38.86 
 
 
432 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  39.49 
 
 
445 aa  262  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 
429 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 
429 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0190  histidinol dehydrogenase  39.45 
 
 
430 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  38.82 
 
 
438 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  38.81 
 
 
437 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16791  histidinol dehydrogenase  35.41 
 
 
428 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.557567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  37.25 
 
 
429 aa  259  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  35.27 
 
 
430 aa  258  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  38.07 
 
 
434 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  39.26 
 
 
434 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  39.26 
 
 
434 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2650  Histidinol dehydrogenase  36.45 
 
 
433 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3041  histidinol dehydrogenase  36.45 
 
 
433 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.2292  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3588  histidinol dehydrogenase  39.81 
 
 
446 aa  256  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.85846  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  38.21 
 
 
422 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  37.72 
 
 
427 aa  253  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  37.23 
 
 
426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  38.06 
 
 
430 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2638  histidinol dehydrogenase  40 
 
 
431 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0261359  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  36.97 
 
 
426 aa  253  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1984  histidinol dehydrogenase  40.54 
 
 
431 aa  253  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  37.28 
 
 
427 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  35.07 
 
 
457 aa  252  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  38.26 
 
 
430 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  36.82 
 
 
424 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  36.41 
 
 
429 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2261  Histidinol dehydrogenase  40.54 
 
 
431 aa  250  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  39.11 
 
 
431 aa  249  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1581  histidinol dehydrogenase  34.93 
 
 
440 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1008  histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 
434 aa  249  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16921  histidinol dehydrogenase  34.13 
 
 
428 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  38.61 
 
 
432 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  37.99 
 
 
435 aa  249  7e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  39.36 
 
 
434 aa  249  8e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  36.45 
 
 
429 aa  249  8e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  36.21 
 
 
429 aa  249  8e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  37.35 
 
 
430 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  36.93 
 
 
428 aa  249  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  35.12 
 
 
424 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  36.17 
 
 
429 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  35.29 
 
 
436 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04331  histidinol dehydrogenase  36.17 
 
 
442 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0727  histidinol dehydrogenase  36.5 
 
 
439 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0760  histidinol dehydrogenase  36.5 
 
 
439 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.570681  normal  0.0561128 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2693  histidinol dehydrogenase  41.98 
 
 
436 aa  247  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.689524  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  36.41 
 
 
446 aa  247  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  37.23 
 
 
437 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  35.63 
 
 
429 aa  247  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>