73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0545 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 615 aa  1253    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  50.99 
 
 		 608 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4162  ATP-dependent endonuclease family protein  42.35 
 
 		 600 aa  402  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138387  normal  0.169092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  40.55 
 
 		 606 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  39.94 
 
 		 619 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  39.91 
 
 		 598 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  38.32 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  39.05 
 
 		 598 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  37.5 
 
 		 641 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  27.17 
 
 		 604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  26.59 
 
 		 610 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  23.87 
 
 		 712 aa  80.5  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  24.05 
 
 		 688 aa  77.8  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.34 
 
 		 634 aa  75.5  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  26.87 
 
 		 758 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  22.5 
 
 		 598 aa  71.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.65 
 
 		 594 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 645 aa  68.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  23.23 
 
 		 645 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  29.79 
 
 		 594 aa  60.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.97 
 
 		 647 aa  59.3  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  22.92 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  46 
 
 		 605 aa  58.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  23.6 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  28.57 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  29.63 
 
 		 574 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  23.46 
 
 		 667 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.28 
 
 		 652 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  27.17 
 
 		 594 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  29.73 
 
 		 448 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.15 
 
 		 607 aa  55.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  29.73 
 
 		 448 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.74 
 
 		 603 aa  54.3  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1102  hypothetical protein  44.68 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.89522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  22.79 
 
 		 685 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  22.83 
 
 		 623 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  22.48 
 
 		 707 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  21.13 
 
 		 703 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.77 
 
 		 640 aa  51.6  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  32.56 
 
 		 666 aa  51.6  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.56 
 
 		 591 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  34.92 
 
 		 529 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  30.84 
 
 		 607 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  54.17 
 
 		 877 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  45.83 
 
 		 513 aa  50.1  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  36.26 
 
 		 478 aa  50.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  23.21 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.6 
 
 		 550 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.64 
 
 		 615 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.3 
 
 		 616 aa  48.5  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  43.75 
 
 		 875 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  47.92 
 
 		 349 aa  48.5  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  21.8 
 
 		 505 aa  48.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  24.77 
 
 		 276 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  28.65 
 
 		 695 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  41.18 
 
 		 877 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  41.18 
 
 		 877 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  41.18 
 
 		 877 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  45.83 
 
 		 883 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.94 
 
 		 573 aa  45.8  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  31.31 
 
 		 681 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  24.53 
 
 		 603 aa  45.8  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  23.26 
 
 		 696 aa  45.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  26.67 
 
 		 566 aa  44.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0863  hypothetical protein  30.43 
 
 		 223 aa  44.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  35.48 
 
 		 581 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  43.75 
 
 		 885 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.53 
 
 		 642 aa  44.3  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2704  hypothetical protein  44.19 
 
 		 581 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00140481  normal  0.0421451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  33.63 
 
 		 661 aa  44.3  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  44.68 
 
 		 566 aa  44.3  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  27.59 
 
 		 426 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  25.6 
 
 		 626 aa  43.9  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>