56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0863 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0863  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.172073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4619  hypothetical protein  30.32 
 
 		 582 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.275765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1994  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.09 
 
 		 590 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  25.56 
 
 		 529 aa  52  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  35.09 
 
 		 369 aa  51.6  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  46.67 
 
 		 370 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0018  RecF protein  48.15 
 
 		 363 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.83 
 
 		 358 aa  48.9  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  35.16 
 
 		 626 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.78 
 
 		 363 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  27.78 
 
 		 586 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  27.78 
 
 		 586 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  31.2 
 
 		 994 aa  46.2  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  42.86 
 
 		 356 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0003  DNA replication and repair protein RecF  45 
 
 		 363 aa  45.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0752559  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  35.87 
 
 		 159 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  27.68 
 
 		 650 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.44 
 
 		 363 aa  45.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.43 
 
 		 615 aa  45.1  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  44.19 
 
 		 339 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  30 
 
 		 1080 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09570  condensin subunit Smc  27.35 
 
 		 1199 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.73 
 
 		 369 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3140  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  40.54 
 
 		 681 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239895  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  47.37 
 
 		 381 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  35 
 
 		 626 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  33.8 
 
 		 460 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  33.73 
 
 		 1198 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  30.59 
 
 		 1195 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  30.59 
 
 		 1195 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 		 552 aa  42.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  32.61 
 
 		 496 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  30.59 
 
 		 1195 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2550  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 		 1191 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.355324  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2505  recombination protein F  48.98 
 
 		 363 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0488541  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  41.67 
 
 		 533 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0781  SMC domain protein  41.3 
 
 		 514 aa  42.4  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  32.53 
 
 		 1199 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  32.53 
 
 		 1199 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  32.53 
 
 		 1199 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  37.7 
 
 		 409 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  28.09 
 
 		 1183 aa  42  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  47.37 
 
 		 377 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  28.09 
 
 		 1194 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  37.74 
 
 		 522 aa  42  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 		 1198 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 		 1198 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  33.75 
 
 		 1191 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  40 
 
 		 562 aa  41.6  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  39.13 
 
 		 371 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 		 1194 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  35.29 
 
 		 370 aa  41.6  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  26.97 
 
 		 1194 aa  41.6  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.27 
 
 		 365 aa  41.6  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  28.09 
 
 		 1224 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  35.48 
 
 		 695 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>