More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3263 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  57.7 
 
 		 678 aa  719    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  51.05 
 
 		 663 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  51.05 
 
 		 663 aa  653    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  50.45 
 
 		 663 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  54.86 
 
 		 666 aa  734    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  54.86 
 
 		 666 aa  734    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  54.26 
 
 		 666 aa  716    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  52.36 
 
 		 657 aa  673    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  48.71 
 
 		 662 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  51.58 
 
 		 670 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  51.58 
 
 		 670 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  52.94 
 
 		 688 aa  655    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2748  transketolase  52.19 
 
 		 690 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.495668 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  51.27 
 
 		 664 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  53.85 
 
 		 666 aa  708    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  50.6 
 
 		 663 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3391  transketolase  52.99 
 
 		 699 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0869549  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  52.79 
 
 		 666 aa  696    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  51.2 
 
 		 663 aa  652    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  50.3 
 
 		 665 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  53.27 
 
 		 668 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  53.54 
 
 		 666 aa  700    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  50.22 
 
 		 668 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  53.39 
 
 		 666 aa  699    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  50.61 
 
 		 723 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  53.39 
 
 		 666 aa  700    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  52.94 
 
 		 690 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  51.12 
 
 		 665 aa  636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  51.05 
 
 		 663 aa  653    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  49.48 
 
 		 670 aa  635    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  48.65 
 
 		 668 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  51.05 
 
 		 663 aa  654    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  50.97 
 
 		 664 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  50.67 
 
 		 671 aa  671    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  52.13 
 
 		 677 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  50.84 
 
 		 661 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  51.05 
 
 		 663 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  51.31 
 
 		 668 aa  647    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  52.94 
 
 		 690 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  52.53 
 
 		 665 aa  660    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  58.58 
 
 		 674 aa  728    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  51.2 
 
 		 664 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  52.64 
 
 		 690 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  51.65 
 
 		 684 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  50.23 
 
 		 680 aa  638    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  53.76 
 
 		 691 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  49.7 
 
 		 694 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  53.7 
 
 		 666 aa  713    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  50.6 
 
 		 663 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  53.54 
 
 		 666 aa  700    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  49.7 
 
 		 668 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  52.29 
 
 		 668 aa  644    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  51.68 
 
 		 671 aa  641    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  52.64 
 
 		 690 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  52.9 
 
 		 664 aa  671    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  55.09 
 
 		 671 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  53.09 
 
 		 696 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  52.28 
 
 		 655 aa  639    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  54.22 
 
 		 711 aa  656    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  52.43 
 
 		 667 aa  649    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  52.53 
 
 		 673 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  51.27 
 
 		 664 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  51.84 
 
 		 663 aa  648    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2599  transketolase  52.38 
 
 		 672 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  53 
 
 		 662 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  54.53 
 
 		 680 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  53.1 
 
 		 671 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  55.09 
 
 		 671 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  52.79 
 
 		 690 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  52.21 
 
 		 663 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  52.15 
 
 		 671 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  52.92 
 
 		 659 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  52.94 
 
 		 690 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  53.15 
 
 		 667 aa  654    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4585  transketolase  52.05 
 
 		 695 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  52.79 
 
 		 690 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  54.14 
 
 		 691 aa  670    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  49.62 
 
 		 666 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  51.05 
 
 		 663 aa  653    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  49.77 
 
 		 662 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  51.27 
 
 		 672 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  51.2 
 
 		 664 aa  646    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  51.05 
 
 		 664 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  52.91 
 
 		 666 aa  654    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  52.91 
 
 		 665 aa  654    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  52.94 
 
 		 675 aa  653    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  53.93 
 
 		 680 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  52.64 
 
 		 690 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  50.76 
 
 		 665 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  52.94 
 
 		 690 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  52.99 
 
 		 667 aa  653    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  54.48 
 
 		 671 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  52.79 
 
 		 690 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  54.14 
 
 		 691 aa  670    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  52.19 
 
 		 668 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  50.9 
 
 		 664 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  51.49 
 
 		 692 aa  645    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  52.94 
 
 		 690 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  50.3 
 
 		 668 aa  647    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  50.38 
 
 		 664 aa  636    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>