242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1785 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  100 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0113  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48.28 
 
 		 209 aa  157  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0384  putative PAS/PAC sensor protein  40.79 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0466  iron dependent repressor  37.07 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.514615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  30.14 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  29.25 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  31.75 
 
 		 134 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  31.75 
 
 		 134 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  31.75 
 
 		 134 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.49 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.05 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.03 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.05 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  30.16 
 
 		 148 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  26.32 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  33.9 
 
 		 139 aa  74.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.25 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.61 
 
 		 126 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  35.77 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.16 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.16 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  30.23 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.2 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.05 
 
 		 227 aa  72  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.36 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  35.09 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.13 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.27 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  29.41 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  37.17 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  34.19 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  35.78 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  30.07 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.7 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.04 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.65 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.88 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  26.27 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  29.95 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.31 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  28.66 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.21 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  30.57 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  30.21 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  28.43 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  30.09 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  33.91 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.05 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  30.89 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  31.71 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.33 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  31.75 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  31.68 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  31.68 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  32.5 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  31.4 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  32.5 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  30.58 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.2 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.58 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.23 
 
 		 176 aa  62  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  28.17 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.74 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.63 
 
 		 240 aa  62  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  30.08 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  27.39 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  28.57 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  32.74 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  25.46 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.51 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  24.89 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.36 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.7 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.02 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  34.43 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.28 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.35 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.11 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  35.45 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  25.91 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.39 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.8 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.13 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  28.78 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  27.39 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  27.39 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  27.39 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.49 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.11 
 
 		 126 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  31.58 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  29.66 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  28.17 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.7 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  29.82 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  30.84 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1082  iron dependent repressor  31.93 
 
 		 135 aa  57  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0224083  hitchhiker  0.00000000150507 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  24.02 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>